120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0873 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  100 
 
 
190 aa  394  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  30.77 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.63 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.12 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.22 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.11 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  26.32 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  26.32 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  25.58 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.67 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.67 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  25.73 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.4 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.67 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.38 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.11 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0378  hypothetical protein  29.27 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913387  hitchhiker  0.000267093 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.36 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  28.28 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  23.78 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.66 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.66 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.66 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.76 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.51 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.84 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.05 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.79 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  29.3 
 
 
192 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  30.33 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.75 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  28.4 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.33 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  24.29 
 
 
200 aa  58.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  28.12 
 
 
163 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.77 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  27.81 
 
 
171 aa  57.8  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  26.14 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  26.09 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  25.15 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.78 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  41.54 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  34.41 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  24.42 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  34.78 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.82 
 
 
151 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  27.74 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  25.45 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.21 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  39.62 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  43.4 
 
 
155 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  27.16 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  25 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  27.16 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  29.03 
 
 
157 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  29.03 
 
 
157 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  26.36 
 
 
188 aa  51.2  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  23.43 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  26.32 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0562  putative fimT protein  27.4 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000705405  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  28.16 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2556  Tfp pilus assembly protein FimT-like  27.57 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  26.22 
 
 
172 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.84 
 
 
194 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  40 
 
 
164 aa  48.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  34.92 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  24.85 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.66 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1621  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  28.3 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000506995  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.15 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.94 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1219  putative type IV pilus biogenesis protein  25.57 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  28.24 
 
 
171 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.27 
 
 
157 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  34.67 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  27.85 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0489  methylation  29.09 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  33.82 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  27.85 
 
 
145 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  27.01 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40.32 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  23.78 
 
 
168 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  34.67 
 
 
186 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  28 
 
 
145 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  30.88 
 
 
186 aa  44.7  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  23.49 
 
 
171 aa  44.7  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0337  hypothetical protein  25.79 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0256489  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  33.9 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  30.11 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  32.35 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.87 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.85 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  25.81 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  32.35 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  29.23 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  24.2 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0297  hypothetical protein  35.29 
 
 
166 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  38.89 
 
 
111 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>