More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0907 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 423 aa  805    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  48.98 
 
 		 416 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  49.58 
 
 		 444 aa  275  8e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  48.53 
 
 		 414 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  47.23 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  40.8 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  41.69 
 
 		 476 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  45.23 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  44.14 
 
 		 376 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  44.14 
 
 		 376 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  40.72 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  37.92 
 
 		 455 aa  209  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  41.62 
 
 		 457 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  38.77 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  40.38 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  35.67 
 
 		 383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  35.79 
 
 		 452 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  36.42 
 
 		 464 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  36.68 
 
 		 487 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  36.49 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  38.24 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  35.95 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  37.8 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  35.88 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  35.88 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  33.68 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  35.99 
 
 		 483 aa  170  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  37.11 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  36.9 
 
 		 381 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  35.99 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  32.27 
 
 		 477 aa  162  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  38.16 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  33.14 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  40.96 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  37.01 
 
 		 367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  35.89 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  36.83 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  34.06 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  41.2 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  36.05 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  34.34 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  36.39 
 
 		 475 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  36.16 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  30.08 
 
 		 429 aa  137  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  31.44 
 
 		 435 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  38 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  30.84 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  35.67 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  34.68 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  32.29 
 
 		 436 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  37.67 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  30.49 
 
 		 363 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  29.7 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  29.19 
 
 		 369 aa  117  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  40 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  29.7 
 
 		 415 aa  113  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  29.09 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  30.15 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  30.77 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  30.38 
 
 		 529 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.48 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  27.03 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  33.2 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  33.71 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  28.21 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  29.62 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  27.98 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  28.61 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  30.46 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  31.43 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  29.63 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.29 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  30.17 
 
 		 365 aa  100  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.03 
 
 		 370 aa  99.8  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  32.92 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  28.27 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 		 354 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  24.67 
 
 		 526 aa  98.6  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  30 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  29.96 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  27.72 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  35 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  27.72 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  27.72 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  27.72 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  28.39 
 
 		 354 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  28.39 
 
 		 354 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 		 389 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  28.39 
 
 		 354 aa  96.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  30 
 
 		 358 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  32.82 
 
 		 392 aa  96.3  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  28.32 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  31.66 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  30.72 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  32.65 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  37.05 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  24.84 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  25 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>