More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0620 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  58.85 
 
 		 211 aa  238  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  53.03 
 
 		 217 aa  207  8e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  55.12 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3103  peptide deformylase  58.82 
 
 		 217 aa  198  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  51.56 
 
 		 217 aa  195  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  54.36 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2193  peptide deformylase  47.17 
 
 		 226 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00150941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  43.19 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  45.56 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  41.85 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  42.86 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  39.22 
 
 		 177 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  40.26 
 
 		 204 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12740  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  48.09 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.869353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  42 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  39.87 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  42.67 
 
 		 178 aa  106  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  40.67 
 
 		 177 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  43.59 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  37.91 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  40.79 
 
 		 186 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  36.08 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  43.38 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  38.07 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  43.65 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  43.65 
 
 		 168 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  43.65 
 
 		 168 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  45.24 
 
 		 177 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  43.08 
 
 		 177 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  44.96 
 
 		 200 aa  99  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  39.47 
 
 		 172 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  38.71 
 
 		 203 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  42.75 
 
 		 179 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  34.83 
 
 		 181 aa  97.8  1e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  36.9 
 
 		 177 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  42.42 
 
 		 178 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  38.56 
 
 		 171 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  37.33 
 
 		 177 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  37.93 
 
 		 180 aa  95.9  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  40.67 
 
 		 177 aa  95.9  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  35.29 
 
 		 187 aa  95.9  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  40.67 
 
 		 177 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  40.67 
 
 		 177 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  40.67 
 
 		 177 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  40.67 
 
 		 177 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  40.67 
 
 		 177 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  39.01 
 
 		 170 aa  95.1  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  38.42 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  40.91 
 
 		 178 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  36.2 
 
 		 189 aa  94.7  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  38 
 
 		 177 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  41.6 
 
 		 174 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  37.33 
 
 		 177 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  32.22 
 
 		 182 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0666  hypothetical protein  34.67 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  41.73 
 
 		 179 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  41.98 
 
 		 179 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  40.15 
 
 		 178 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  41.27 
 
 		 168 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  39.86 
 
 		 168 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  42.4 
 
 		 177 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  38.16 
 
 		 179 aa  93.6  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  40.58 
 
 		 178 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  38.16 
 
 		 179 aa  93.6  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  44.05 
 
 		 190 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  39.86 
 
 		 168 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  37.27 
 
 		 167 aa  93.2  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  44.88 
 
 		 170 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  43.7 
 
 		 179 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  34.9 
 
 		 184 aa  92.8  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  38.64 
 
 		 179 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  33.33 
 
 		 196 aa  92.4  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  40.48 
 
 		 168 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  35.06 
 
 		 181 aa  92  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  41.4 
 
 		 182 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  37.27 
 
 		 167 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  36.77 
 
 		 176 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  36.31 
 
 		 178 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  37.34 
 
 		 179 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  42.06 
 
 		 168 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  42.35 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  37.18 
 
 		 184 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  43.65 
 
 		 168 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  40.26 
 
 		 167 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  39.52 
 
 		 171 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  40.13 
 
 		 179 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  36.31 
 
 		 178 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  36.59 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  42.5 
 
 		 177 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  33.55 
 
 		 162 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  37.18 
 
 		 184 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  39.74 
 
 		 171 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  41.73 
 
 		 169 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  34.27 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  39.62 
 
 		 192 aa  89.4  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  44.23 
 
 		 191 aa  89.4  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  42.26 
 
 		 190 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>