82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1997 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 303 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1126  NHL repeat containing protein  52.45 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.330169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2493  NHL repeat-containing protein  47.31 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  45.26 
 
 		 297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  43.37 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  43.8 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1838  NHL repeat-containing protein  41.64 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.73 
 
 		 930 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  24.51 
 
 		 676 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  25.48 
 
 		 390 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  25.12 
 
 		 491 aa  89.7  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  24.44 
 
 		 579 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  26.01 
 
 		 346 aa  85.5  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  24.44 
 
 		 709 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  23.62 
 
 		 831 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  23.43 
 
 		 668 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  23.1 
 
 		 627 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  25.83 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25.47 
 
 		 588 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25.65 
 
 		 752 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  28.1 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  27.88 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.25 
 
 		 1293 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  21.54 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.89 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  24.44 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  23.64 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.63 
 
 		 930 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  25.54 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  22.81 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.21 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  26.02 
 
 		 786 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1146 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  25.79 
 
 		 1140 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.15 
 
 		 1079 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  22.81 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  22.15 
 
 		 1163 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  21.6 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 		 732 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  22.51 
 
 		 1030 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  24.62 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  22.76 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  23.32 
 
 		 1750 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  25.11 
 
 		 700 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.69 
 
 		 693 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  24.4 
 
 		 525 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  23.72 
 
 		 392 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  26.86 
 
 		 355 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1177 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  25.16 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 770 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  23.48 
 
 		 379 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  26.25 
 
 		 660 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  25.79 
 
 		 664 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 		 1230 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1030 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1068 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  24.85 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  26.79 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  23.11 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  25.15 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  21.28 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  22.22 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4125  NHL repeat-containing protein  27.23 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.622365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  23.14 
 
 		 395 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  26.83 
 
 		 639 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  27.81 
 
 		 360 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  22.94 
 
 		 850 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  22.87 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.07 
 
 		 2114 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  22.95 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1834 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  26.92 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  22.16 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  25.23 
 
 		 841 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.42 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1763 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0291  NHL repeat-containing protein  23.38 
 
 		 669 aa  43.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  24.44 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  23.35 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  25.37 
 
 		 630 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>