More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1451 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  100 
 
 		 371 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  58.95 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  51.32 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  48.04 
 
 		 380 aa  316  5e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  47.29 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1394  integrase family protein  43.85 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  43.19 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  41.67 
 
 		 374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1401  hypothetical protein  52.75 
 
 		 323 aa  226  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0795  integrase family protein  33.25 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5647  integrase family protein  31.74 
 
 		 410 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  32.36 
 
 		 422 aa  125  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1973  integrase family protein  30.61 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0126366 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.16 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  29.62 
 
 		 357 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.92 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.93 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1936  phage integrase family protein  40.59 
 
 		 194 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0331565  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  30.59 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.75 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.09 
 
 		 325 aa  92.8  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.35 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  28.33 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  30.34 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.33 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  21.02 
 
 		 373 aa  89.4  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.89 
 
 		 365 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.67 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.92 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.67 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  21.83 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  25.77 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.82 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.82 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.12 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  20.13 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.77 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.36 
 
 		 477 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.1 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  22.03 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  31.01 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  27.6 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.74 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  28.27 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.74 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  24.55 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.87 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.08 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  22.59 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.17 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.33 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  23.19 
 
 		 656 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.3 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  21.2 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  24.92 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  21.52 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.21 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.31 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  28.62 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  21.74 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  28.38 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.68 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  27.46 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.82 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.2 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.56 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  21.17 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  31.42 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  22.46 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  28.81 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.61 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  25.76 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  23.67 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  20.88 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  20.88 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  20.91 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  27.27 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  31.18 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  24.3 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  27.61 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  22.41 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.16 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  27.24 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  22.93 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  26.39 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.17 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  31.18 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.52 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  27.24 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  30.86 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  22.29 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  21.99 
 
 		 494 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25.93 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  21.03 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>