110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2572 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  35.05 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  30.73 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 209 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  29.58 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3925  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.376299  normal  0.034998 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 273 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0679  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 217 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  45.4  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1788  regulatory protein TetR  39.06 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6398  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237377  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  38.75 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  26.52 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3134  hypothetical protein  25.82 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.744862  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  36.54 
 
 		 184 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 197 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 211 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 185 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  39.66 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  29.25 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 208 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>