172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3545 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  53.05 
 
 		 841 aa  904    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  49.39 
 
 		 845 aa  838    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  55.91 
 
 		 837 aa  947    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  100 
 
 		 811 aa  1677    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  88.89 
 
 		 819 aa  1525    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.76 
 
 		 792 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  28.61 
 
 		 809 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  26.09 
 
 		 815 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  24.59 
 
 		 815 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  22.88 
 
 		 815 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  25.24 
 
 		 865 aa  106  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  26.91 
 
 		 827 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  26.37 
 
 		 690 aa  102  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  25.15 
 
 		 874 aa  99  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  26.56 
 
 		 862 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  26.56 
 
 		 862 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  23.19 
 
 		 800 aa  90.1  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  26.56 
 
 		 862 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  26.56 
 
 		 862 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  26.56 
 
 		 862 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.28 
 
 		 595 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.6 
 
 		 629 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.75 
 
 		 868 aa  88.6  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.68 
 
 		 608 aa  88.2  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  24.47 
 
 		 855 aa  87.8  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  22.7 
 
 		 800 aa  87.8  7e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  23.29 
 
 		 860 aa  87.8  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.87 
 
 		 875 aa  87.8  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  24.2 
 
 		 855 aa  87.4  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  26.55 
 
 		 858 aa  87.4  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  23.17 
 
 		 803 aa  86.3  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  23.6 
 
 		 847 aa  85.9  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  22.07 
 
 		 788 aa  85.1  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.67 
 
 		 659 aa  84.7  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  25.59 
 
 		 866 aa  84.3  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.68 
 
 		 629 aa  84  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  25.5 
 
 		 864 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  26.46 
 
 		 862 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  23.52 
 
 		 819 aa  78.6  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  21.9 
 
 		 839 aa  77  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  25.63 
 
 		 864 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  21.31 
 
 		 801 aa  74.7  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  22.05 
 
 		 841 aa  74.3  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  22.59 
 
 		 816 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.2 
 
 		 796 aa  73.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.2 
 
 		 860 aa  72  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.29 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  27.02 
 
 		 843 aa  71.6  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.73 
 
 		 790 aa  70.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  22.77 
 
 		 561 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.09 
 
 		 793 aa  69.3  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  21.69 
 
 		 816 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  20.96 
 
 		 922 aa  67  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.27 
 
 		 915 aa  66.6  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  21.87 
 
 		 816 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.02 
 
 		 785 aa  65.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  19.48 
 
 		 845 aa  65.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  20.38 
 
 		 861 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  21.18 
 
 		 823 aa  65.1  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  22.88 
 
 		 824 aa  64.7  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  22.1 
 
 		 814 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  20.69 
 
 		 816 aa  63.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  23.47 
 
 		 812 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  20.94 
 
 		 823 aa  62.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  21.32 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.83 
 
 		 805 aa  63.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  21.76 
 
 		 924 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.28 
 
 		 830 aa  62.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  23.57 
 
 		 812 aa  62.4  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  20.88 
 
 		 816 aa  62  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  21.04 
 
 		 822 aa  61.6  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.45 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.28 
 
 		 804 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  21.17 
 
 		 817 aa  60.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.03 
 
 		 805 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  21.18 
 
 		 817 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.73 
 
 		 815 aa  59.7  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  22.71 
 
 		 813 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  20.68 
 
 		 819 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  21.17 
 
 		 817 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  21.13 
 
 		 845 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.29 
 
 		 630 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  21.1 
 
 		 813 aa  58.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  21.17 
 
 		 817 aa  58.9  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.77 
 
 		 826 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.77 
 
 		 826 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  22.83 
 
 		 687 aa  58.9  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  21.29 
 
 		 822 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  20.44 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  20.1 
 
 		 915 aa  57.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  23.31 
 
 		 819 aa  57.8  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  21.3 
 
 		 847 aa  57.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  21.71 
 
 		 826 aa  57.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.81 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  20.26 
 
 		 809 aa  57.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  22.01 
 
 		 826 aa  57  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  21.65 
 
 		 819 aa  57.4  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  22.6 
 
 		 820 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.32 
 
 		 819 aa  57.4  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  19.59 
 
 		 866 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>