87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0763 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0763  TonB-dependent receptor  100 
 
 
891 aa  1806    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1820  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 
877 aa  173  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1020  hypothetical protein  22.43 
 
 
936 aa  149  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00854238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 
933 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 
1064 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 
1064 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 
1062 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 
1074 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  23.24 
 
 
1088 aa  58.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 
1027 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 
1062 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 
1071 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 
1028 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 
1068 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 
1153 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  33.57 
 
 
1095 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 
1115 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 
1137 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 
1088 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  28.26 
 
 
1028 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
874 aa  52.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  24.66 
 
 
833 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 
1036 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6682  TonB-dependent receptor plug  24.65 
 
 
1085 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
1093 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 
634 aa  52.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 
1059 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 
1107 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 
986 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 
792 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
763 aa  50.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 
1013 aa  51.2  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 
1039 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 
1029 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  26.77 
 
 
914 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.88 
 
 
1025 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 
1041 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 
1066 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 
1186 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 
1031 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 
1105 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 
918 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 
1047 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  26.21 
 
 
1030 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 
1003 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 
1094 aa  48.5  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 
1011 aa  48.5  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  20.43 
 
 
780 aa  48.5  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 
793 aa  48.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 
998 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 
986 aa  48.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
887 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 
770 aa  47.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 
1020 aa  48.1  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  24.76 
 
 
979 aa  47.8  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 
1102 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 
793 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 
1097 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  32 
 
 
646 aa  47  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 
1059 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 
1175 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1781  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 
1055 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  29.57 
 
 
613 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 
1148 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30 
 
 
1038 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 
918 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 
929 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 
1142 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 
923 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  29.85 
 
 
1005 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 
769 aa  45.4  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 
1073 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 
1128 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 
1114 aa  45.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  27.14 
 
 
1080 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  19.83 
 
 
897 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 
1051 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  28.11 
 
 
977 aa  44.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  25.14 
 
 
690 aa  44.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 
971 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 
1117 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 
1040 aa  44.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 
1080 aa  44.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 
1154 aa  45.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 
1129 aa  44.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1770  hypothetical protein  36.61 
 
 
242 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  23.74 
 
 
846 aa  44.3  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>