112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0359 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 448 aa  908    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1030 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  31.98 
 
 		 1351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 892 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 850 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1750 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1026 aa  116  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  28.18 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.03 
 
 		 831 aa  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  28.35 
 
 		 963 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.04 
 
 		 627 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 		 772 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  28.81 
 
 		 930 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1051 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1763 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  27.87 
 
 		 668 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 732 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.43 
 
 		 676 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.15 
 
 		 343 aa  96.7  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  28.93 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  28.83 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  28.09 
 
 		 646 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  26.71 
 
 		 579 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.11 
 
 		 693 aa  90.1  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  35.54 
 
 		 2831 aa  90.1  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.35 
 
 		 1130 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.6 
 
 		 1292 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  25.16 
 
 		 709 aa  87  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  29.8 
 
 		 2961 aa  86.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.88 
 
 		 752 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.29 
 
 		 2296 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.46 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  24.83 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  25.45 
 
 		 1046 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  24.5 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  27.49 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  27.01 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.16 
 
 		 930 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  25.73 
 
 		 1079 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  26.27 
 
 		 841 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 		 719 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  26.96 
 
 		 786 aa  77  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  22.79 
 
 		 1293 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  27.05 
 
 		 623 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  34.15 
 
 		 664 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  27.54 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  23.03 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 756 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25.9 
 
 		 588 aa  70.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1030 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  26.3 
 
 		 863 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 		 807 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  25.82 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 770 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1146 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  24.15 
 
 		 805 aa  65.1  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  27.11 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  33.1 
 
 		 1916 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1834 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1163 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  26.56 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  24.92 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  27.39 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  24.08 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  24.65 
 
 		 903 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  25.36 
 
 		 581 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  28.09 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  21.78 
 
 		 502 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  22.88 
 
 		 2350 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.17 
 
 		 711 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  24.8 
 
 		 353 aa  53.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  26.9 
 
 		 1140 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.43 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  25.15 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2493  NHL repeat-containing protein  33.08 
 
 		 260 aa  50.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  21.6 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  21.33 
 
 		 297 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  22.76 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25.62 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  36.96 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2644  hypothetical protein  26.06 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0696665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  27.59 
 
 		 672 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.46 
 
 		 321 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1177 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  32.99 
 
 		 694 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  23.44 
 
 		 950 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  24.21 
 
 		 343 aa  47.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  20.67 
 
 		 297 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  28.03 
 
 		 355 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  22.81 
 
 		 510 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  21.67 
 
 		 297 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  30.71 
 
 		 284 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  24.2 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  22.97 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  20.52 
 
 		 361 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  28.11 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  23.7 
 
 		 503 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 1230 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  23.85 
 
 		 470 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  25.56 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>