More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2457 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2457  diguanylate cyclase  100 
 
 		 316 aa  652    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  39.27 
 
 		 492 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3387  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 385 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610096  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0426  putative GGDEF protein  31.3 
 
 		 413 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0261  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 463 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3903  diguanylate cyclase  38.01 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0522591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2326  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.24 
 
 		 536 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3603  GGDEF domain-containing protein  36.53 
 
 		 641 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0057  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.95 
 
 		 550 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  37.36 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3686  diguanylate cyclase  36.69 
 
 		 385 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  39.26 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6137  diguanylate cyclase  36.47 
 
 		 551 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11555  normal  0.0857113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  29.63 
 
 		 686 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0267  diguanylate cyclase  35.98 
 
 		 1320 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1039  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.23 
 
 		 393 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0950507  normal  0.205042 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  38.07 
 
 		 611 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0039  diguanylate cyclase  30.6 
 
 		 521 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0290  diguanylate cyclase  34.83 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1197  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.95 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  34.86 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0674  diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.43 
 
 		 675 aa  103  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3414  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.15 
 
 		 673 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2365  diguanylate cyclase  35.44 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108211  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  34.73 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  34.01 
 
 		 775 aa  102  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2021  diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1745  diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 401 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.597218  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2293  diguanylate cyclase  34.81 
 
 		 467 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000112238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  29.72 
 
 		 674 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  38.82 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.18 
 
 		 917 aa  102  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2884  diguanylate cyclase  31.05 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000365079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5832  diguanylate cyclase  37.06 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  37.11 
 
 		 499 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26970  hypothetical protein  30.15 
 
 		 525 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.24 
 
 		 572 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1272  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 632 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0623275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0164  diguanylate cyclase  32.57 
 
 		 437 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.890841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2077  diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.793636  normal  0.406002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1789  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.86 
 
 		 794 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.993763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6549  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 546 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  33.5 
 
 		 696 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 1037 aa  99.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2284  hypothetical protein  29.65 
 
 		 525 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0619167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2127  response regulator  39.13 
 
 		 544 aa  99.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  31.67 
 
 		 722 aa  99.4  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  35.15 
 
 		 778 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5563  putative two-component response regulator  34.97 
 
 		 542 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0544  diguanylate cyclase  35.87 
 
 		 414 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0340  diguanylate cyclase  32.18 
 
 		 428 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  35.39 
 
 		 506 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  31.88 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1366  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2758  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.85 
 
 		 698 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2130  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.36 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 464 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64050  putative two-component response regulator  34.81 
 
 		 542 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.18 
 
 		 901 aa  97.4  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.57 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2483  diguanylate cyclase  34.18 
 
 		 467 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2229  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.81 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2157  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 559 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  hitchhiker  0.000000586134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  35.87 
 
 		 485 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  36 
 
 		 425 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  38.93 
 
 		 474 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1440  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.14 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0301186  normal  0.059237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2154  GGDEF  35.67 
 
 		 411 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1429  diguanylate cyclase  33.49 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2036  diguanylate cyclase  35.67 
 
 		 381 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0190259 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  34.21 
 
 		 506 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0294  diguanylate cyclase  33.49 
 
 		 504 aa  96.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 381 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4177  diguanylate cyclase  35.21 
 
 		 347 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6048  diguanylate cyclase  34.21 
 
 		 506 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.423069 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.92 
 
 		 772 aa  96.3  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 411 aa  96.3  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2118  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.43 
 
 		 346 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  37.64 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3392  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.33 
 
 		 406 aa  95.9  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  34.91 
 
 		 638 aa  95.9  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0130  diguanylate cyclase  38.06 
 
 		 392 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4831  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 392 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2580  GGDEF domain-containing protein  34.32 
 
 		 1774 aa  95.9  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  34.67 
 
 		 494 aa  95.9  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0362  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 890 aa  95.9  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  30.54 
 
 		 715 aa  95.9  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  37.74 
 
 		 395 aa  95.5  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000814  hypothetical protein  34.32 
 
 		 402 aa  95.5  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2212  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 543 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1123  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  35.23 
 
 		 499 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  30.29 
 
 		 540 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1783  diguanylate cyclase  27.52 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2824  GGDEF domain-containing protein  34.52 
 
 		 628 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.44 
 
 		 715 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  35.23 
 
 		 499 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  37.74 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>