More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1761 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  47.71 
 
 		 767 aa  698    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 769 aa  1568    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  42.04 
 
 		 852 aa  596  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  42.03 
 
 		 786 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  40.08 
 
 		 782 aa  552  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  38.92 
 
 		 785 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  39.9 
 
 		 810 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  38.57 
 
 		 907 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  39.76 
 
 		 789 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  37.16 
 
 		 810 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  37.86 
 
 		 816 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  36.76 
 
 		 806 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 		 809 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 		 795 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  33.74 
 
 		 808 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 812 aa  300  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 791 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 824 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 807 aa  255  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 809 aa  241  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 794 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 793 aa  234  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 843 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 850 aa  213  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 776 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 862 aa  208  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 805 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 795 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 864 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 781 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 789 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 817 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 708 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 859 aa  190  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 815 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 825 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 825 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 696 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.44 
 
 		 696 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 837 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 860 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 742 aa  180  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 711 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  24.4 
 
 		 792 aa  168  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 708 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 719 aa  167  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 796 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 741 aa  165  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.93 
 
 		 709 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.52 
 
 		 708 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 797 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.06 
 
 		 713 aa  162  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 722 aa  161  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 717 aa  161  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 710 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 713 aa  160  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 786 aa  160  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.91 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 717 aa  159  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 701 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.19 
 
 		 703 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.99 
 
 		 801 aa  157  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.4 
 
 		 703 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 		 713 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 703 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 745 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 733 aa  156  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 701 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 734 aa  153  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  25.74 
 
 		 740 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 709 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.09 
 
 		 711 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 689 aa  152  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 743 aa  152  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 770 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 707 aa  151  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 742 aa  151  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 710 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 742 aa  151  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 806 aa  151  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 730 aa  150  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  26.53 
 
 		 689 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 809 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 699 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 715 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 792 aa  148  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2327  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 790 aa  147  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929044  normal  0.271692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  27.44 
 
 		 691 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 706 aa  146  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  26.14 
 
 		 799 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 736 aa  146  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 738 aa  146  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 726 aa  145  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  23.56 
 
 		 719 aa  145  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5324  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 710 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0890511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.12 
 
 		 833 aa  145  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 710 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  24.26 
 
 		 716 aa  144  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 742 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 829 aa  144  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>