79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0095 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  100 
 
 		 944 aa  1939    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  32.51 
 
 		 946 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  26.31 
 
 		 961 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  24.64 
 
 		 930 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  25.31 
 
 		 965 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  25.03 
 
 		 904 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  26.51 
 
 		 847 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 998 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  32.04 
 
 		 946 aa  164  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  25.03 
 
 		 929 aa  161  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  24.18 
 
 		 921 aa  158  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  30.87 
 
 		 924 aa  145  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  37.17 
 
 		 887 aa  145  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  31.12 
 
 		 952 aa  134  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  32.31 
 
 		 926 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  31.36 
 
 		 915 aa  128  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  29.32 
 
 		 908 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  28.14 
 
 		 872 aa  111  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  26.3 
 
 		 895 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  28.52 
 
 		 877 aa  108  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  24.48 
 
 		 995 aa  88.6  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  25.09 
 
 		 936 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 822 aa  84.7  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 824 aa  84.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 828 aa  82  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 814 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 826 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 832 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 847 aa  77.8  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 791 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 813 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 973 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 853 aa  74.7  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 818 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 817 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  26.12 
 
 		 815 aa  72.8  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 852 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  28.16 
 
 		 929 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  25 
 
 		 879 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 813 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25.66 
 
 		 805 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 869 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 829 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 804 aa  69.7  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 812 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 866 aa  65.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 820 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 821 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 810 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 805 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  20.72 
 
 		 891 aa  60.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 818 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 766 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 813 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 795 aa  55.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 819 aa  55.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 803 aa  54.7  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 810 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  23.51 
 
 		 799 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 806 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  22.76 
 
 		 894 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 812 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 833 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 814 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 897 aa  51.6  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  23.18 
 
 		 920 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 808 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 713 aa  49.7  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 791 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 802 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 705 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  28.16 
 
 		 972 aa  47  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  28.66 
 
 		 767 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 817 aa  46.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 		 823 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  31.34 
 
 		 772 aa  45.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 763 aa  44.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>