165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1727 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  66.18 
 
 		 480 aa  679    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  70.42 
 
 		 505 aa  722    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 493 aa  1035    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  66.25 
 
 		 480 aa  699    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  61.17 
 
 		 481 aa  629  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  58.68 
 
 		 481 aa  610  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  59.38 
 
 		 482 aa  595  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  40.51 
 
 		 485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  37.34 
 
 		 492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  39.75 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  39.55 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  38.02 
 
 		 493 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  38.02 
 
 		 493 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  38.71 
 
 		 513 aa  299  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  41.12 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  27.86 
 
 		 1229 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 		 1214 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 		 1231 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  26.97 
 
 		 1202 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  27.83 
 
 		 1253 aa  150  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  26.37 
 
 		 1153 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  25.87 
 
 		 1101 aa  143  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  24.9 
 
 		 1181 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  27.25 
 
 		 1118 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  27 
 
 		 1118 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  27.65 
 
 		 1144 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  25.11 
 
 		 1201 aa  140  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  25.86 
 
 		 1186 aa  140  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  25 
 
 		 1193 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  25.86 
 
 		 1172 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  24.51 
 
 		 1128 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  24.95 
 
 		 1167 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  26.75 
 
 		 1177 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  24.22 
 
 		 1165 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  25.94 
 
 		 1164 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  26.2 
 
 		 1173 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  27 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  23.06 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  25.51 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  25.97 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  24.02 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  25.15 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  25.94 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  23.8 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  25.15 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  22.24 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  25.34 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  22.61 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  24.87 
 
 		 687 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  26.38 
 
 		 534 aa  66.6  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  24.8 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  24.33 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  23.4 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  24.11 
 
 		 673 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  21.3 
 
 		 728 aa  60.5  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  22.17 
 
 		 650 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  23.31 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.58 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  21.16 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  24.56 
 
 		 420 aa  57  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  22.24 
 
 		 610 aa  57  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  25.25 
 
 		 537 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  21.55 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  24.26 
 
 		 704 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  23.43 
 
 		 626 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  22.95 
 
 		 624 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  21.96 
 
 		 607 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  27.18 
 
 		 687 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  21.41 
 
 		 624 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  24.11 
 
 		 709 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.78 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 643 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  20.74 
 
 		 605 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  25.08 
 
 		 581 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  23.75 
 
 		 402 aa  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  24.8 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  23.78 
 
 		 549 aa  50.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  25.2 
 
 		 666 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1294  alpha amylase, catalytic domain protein  22.09 
 
 		 566 aa  50.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  26.11 
 
 		 659 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  20.73 
 
 		 589 aa  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  25.13 
 
 		 708 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  25.95 
 
 		 645 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  26.67 
 
 		 534 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  20.76 
 
 		 654 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  30.95 
 
 		 630 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  25 
 
 		 701 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  21.1 
 
 		 605 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  20.4 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  21.1 
 
 		 605 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  21.1 
 
 		 605 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  24 
 
 		 638 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  21.1 
 
 		 605 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  21.1 
 
 		 605 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  21.1 
 
 		 605 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  21.1 
 
 		 605 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  22.92 
 
 		 758 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  25.79 
 
 		 716 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  23.42 
 
 		 529 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>