More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3567 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 234 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 239 aa  224  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 191 aa  95.5  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1892  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 346 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  46.97 
 
 		 190 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5365  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 176 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 280 aa  52  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  40.57 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  24.3 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 423 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  36.67 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 414 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 125 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  42.47 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  38.57 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  41.05 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 193 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 194 aa  48.5  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  33.9 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  33.9 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  33.9 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  33.9 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  33.9 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>