106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1515 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.74 
 
 
998 aa  767    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.14 
 
 
762 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.42 
 
 
786 aa  692    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  51.92 
 
 
1105 aa  894    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
1100 aa  2212    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  54.71 
 
 
864 aa  734    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  50 
 
 
851 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.46 
 
 
927 aa  568  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  49.2 
 
 
875 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  41.21 
 
 
895 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  41.35 
 
 
1224 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  51.29 
 
 
775 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  47.52 
 
 
812 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.76 
 
 
867 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  38.87 
 
 
885 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  35.96 
 
 
874 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.32 
 
 
611 aa  343  9e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.48 
 
 
582 aa  251  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  31.67 
 
 
854 aa  250  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  33.39 
 
 
587 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  31.35 
 
 
571 aa  248  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  29.8 
 
 
646 aa  228  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  30.94 
 
 
591 aa  224  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 
649 aa  214  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  31.18 
 
 
578 aa  209  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
1601 aa  199  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  28.48 
 
 
833 aa  184  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.98 
 
 
900 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  28.21 
 
 
537 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  41.34 
 
 
532 aa  108  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  26.29 
 
 
803 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  25.8 
 
 
739 aa  105  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  25.54 
 
 
665 aa  97.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 
632 aa  95.1  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  39.67 
 
 
737 aa  93.6  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  25.99 
 
 
621 aa  89  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  26.37 
 
 
2042 aa  86.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  24.85 
 
 
906 aa  85.9  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  36.32 
 
 
979 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 
606 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  34.43 
 
 
14944 aa  82.4  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0991  hypothetical protein  36.57 
 
 
760 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0581  Htaa domain protein  35.78 
 
 
1098 aa  77.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.892764  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  31.84 
 
 
3563 aa  76.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  24.37 
 
 
1076 aa  75.5  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  23.12 
 
 
978 aa  75.1  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  24.25 
 
 
815 aa  75.1  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  34.01 
 
 
1127 aa  74.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2988  Htaa domain protein  48.98 
 
 
994 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360944  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.19 
 
 
540 aa  71.2  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  38.05 
 
 
1550 aa  70.1  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  25.34 
 
 
794 aa  70.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  22.27 
 
 
707 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  24.03 
 
 
880 aa  66.6  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.7 
 
 
1607 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.32 
 
 
887 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.43 
 
 
1507 aa  64.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  23.22 
 
 
739 aa  61.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  22.05 
 
 
611 aa  60.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 
846 aa  60.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  32.2 
 
 
2262 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.17 
 
 
985 aa  60.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.34 
 
 
1130 aa  60.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  24.01 
 
 
757 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.5 
 
 
810 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  22.54 
 
 
725 aa  60.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 
789 aa  58.9  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.89 
 
 
887 aa  58.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 
742 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  21.78 
 
 
563 aa  57  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 
1321 aa  57  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  31.67 
 
 
1132 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  24.44 
 
 
847 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.76 
 
 
1362 aa  55.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.32 
 
 
714 aa  55.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2581  putative chitobiase (exoglucosidase)  28.26 
 
 
575 aa  55.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  23.38 
 
 
961 aa  54.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  24.95 
 
 
990 aa  53.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 
928 aa  53.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  21.66 
 
 
526 aa  53.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  31.05 
 
 
1969 aa  52.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  44.29 
 
 
721 aa  52  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  39.52 
 
 
2207 aa  52  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  34.86 
 
 
559 aa  52  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  40 
 
 
1243 aa  51.6  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  22.89 
 
 
949 aa  51.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  34.17 
 
 
1657 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  26.02 
 
 
570 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  35.63 
 
 
972 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  33.33 
 
 
683 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5626  Htaa domain protein  40.71 
 
 
800 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35 
 
 
408 aa  49.7  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  23.49 
 
 
1369 aa  49.3  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4776  glycosy hydrolase family protein  26.02 
 
 
606 aa  48.9  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.520076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  24.55 
 
 
1017 aa  48.9  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  28.5 
 
 
653 aa  48.5  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.11 
 
 
1183 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  22.81 
 
 
778 aa  47.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  21.85 
 
 
730 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002581  glucosamine-link cellobiase  29.31 
 
 
579 aa  47  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>