More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0905 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0905  diguanylate cyclase  100 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2568  diguanylate cyclase  47.74 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2079  diguanylate cyclase  48.58 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000777268  hitchhiker  0.0000000000000132313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3959  diguanylate cyclase  43.01 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.269646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1387  diguanylate cyclase  47.06 
 
 		 336 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.617999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6847  diguanylate cyclase  42.53 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1237  diguanylate cyclase  40.88 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1448  diguanylate cyclase  42.78 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4653  diguanylate cyclase  43.12 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1425  GGDEF domain-containing protein  42.68 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0983  GGDEF family protein  36.36 
 
 		 443 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2747  diguanylate cyclase  36.27 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86983  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3061  GGDEF domain-containing protein  36.6 
 
 		 469 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2363  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 214 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.630601  normal  0.137832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1797  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.24 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.504833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2220  GGDEF  41.42 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2370  diguanylate cyclase  33.17 
 
 		 554 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.7 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  39.1 
 
 		 413 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.42 
 
 		 1073 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1149  diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 495 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4585  diguanylate cyclase  37.7 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.704428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1200  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.05 
 
 		 619 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4551  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.14 
 
 		 313 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111866  normal  0.524526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 680 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  40 
 
 		 611 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03790  sensory box GGDEF domain-containing protein  37.11 
 
 		 323 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.228486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0381  hypothetical protein  37.11 
 
 		 323 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0356  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.76 
 
 		 667 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.589026  normal  0.448313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.24 
 
 		 424 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  41.06 
 
 		 417 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2390  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 		 600 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2668  diguanylate cyclase  43.51 
 
 		 390 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5509  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.48 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0655  diguanylate cyclase  36.47 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0803  diguanylate cyclase  38.31 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2805  diguanylate cyclase  31.75 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.726204  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0094  diguanylate cyclase  34.41 
 
 		 451 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3115  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 626 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.972183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.22 
 
 		 1078 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.73 
 
 		 586 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1501  diguanylate cyclase  34.43 
 
 		 360 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.15986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 343 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0009  diguanylate cyclase  41.77 
 
 		 312 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0467  diguanylate cyclase  36.61 
 
 		 641 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  33.96 
 
 		 388 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  33.18 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0335  PAS sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.61 
 
 		 979 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000621491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 681 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5175  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.48 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  43.42 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5684  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.48 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656373  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  34.83 
 
 		 624 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2363  GGDEF domain-containing protein  40.38 
 
 		 311 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.282615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1895  diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 555 aa  105  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1957  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.35 
 
 		 975 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003519  diguanylate cyclase (GGDEF domain) with PAS/PAC sensor  34.03 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000133532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2763  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.02 
 
 		 820 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  30.56 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0014  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.48 
 
 		 312 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.927772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2758  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.91 
 
 		 698 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  35.8 
 
 		 569 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4425  GGDEF family protein  30.08 
 
 		 435 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1163  diguanylate cyclase  37.66 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  39.35 
 
 		 492 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7031  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.55 
 
 		 1327 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7026  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.38 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.398098  hitchhiker  0.000000633587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2750  diguanylate cyclase  35.14 
 
 		 380 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0284  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 391 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.879349  unclonable  0.0000000000722624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.46 
 
 		 327 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4956  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.83 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0364888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2237  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.12 
 
 		 556 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  36.81 
 
 		 631 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0076  GGDEF domain-containing protein  34.3 
 
 		 524 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.790276  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1749  PAS:GGDEF  36.25 
 
 		 476 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0218536  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  31.58 
 
 		 591 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 621 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1137  diguanylate cyclase  42 
 
 		 721 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  34.97 
 
 		 387 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.51 
 
 		 994 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1630  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.11 
 
 		 739 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  33.68 
 
 		 464 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.79 
 
 		 730 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6762  diguanylate cyclase  36.61 
 
 		 411 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1272  diguanylate cyclase  39.38 
 
 		 632 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0623275  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 718 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  38.31 
 
 		 417 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1952  hypothetical protein  39.6 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00612967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1199  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341711  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  35.48 
 
 		 354 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2097  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.71 
 
 		 800 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2324  hypothetical protein  37.31 
 
 		 506 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1159  PAS:GGDEF  41.83 
 
 		 748 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0100  diguanylate cyclase  36.32 
 
 		 446 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2748  diguanylate cyclase  34.18 
 
 		 651 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0199433  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1917  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.64 
 
 		 1028 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3966  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.05 
 
 		 332 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4141  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.38 
 
 		 312 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3642  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.71 
 
 		 796 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127426  normal  0.751556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1078  diguanylate cyclase  37.35 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.239628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>