More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6701 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 279 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 306 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  42.7 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  44.4 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 319 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1249  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1911  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  34.9 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  27.01 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  32.96 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 316 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  37.41 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  37.16 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  32.49 
 
 		 331 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 331 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4179  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  34.9 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 303 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 319 aa  99.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  38.26 
 
 		 324 aa  99  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.71 
 
 		 338 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  33.69 
 
 		 329 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  30.73 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 		 334 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 342 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 305 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  33.69 
 
 		 329 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 348 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 348 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 332 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 323 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>