232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4590 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  99.44 
 
 		 179 aa  361  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  96.3 
 
 		 162 aa  294  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  95.68 
 
 		 162 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  95.68 
 
 		 162 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  95.06 
 
 		 162 aa  287  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 158 aa  188  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  59.86 
 
 		 155 aa  185  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  42.58 
 
 		 177 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 150 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  39.31 
 
 		 151 aa  99  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 148 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 150 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  89.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 178 aa  87.8  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 159 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 315 aa  75.1  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 143 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  31.32 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  31.34 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  30.6 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  30.6 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  30.6 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  30.6 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 146 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 138 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  34 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 141 aa  51.2  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  30.08 
 
 		 149 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  33.53 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>