262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0160 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  49.12 
 
 		 958 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  100 
 
 		 952 aa  1973    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  53.14 
 
 		 852 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  53.26 
 
 		 954 aa  698    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  53.26 
 
 		 954 aa  698    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  49.06 
 
 		 962 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  51.66 
 
 		 994 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  48.92 
 
 		 980 aa  669    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  53.26 
 
 		 954 aa  698    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  49.06 
 
 		 962 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  46.88 
 
 		 921 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  47.14 
 
 		 952 aa  561  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  46.98 
 
 		 910 aa  559  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  46.55 
 
 		 952 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  46.51 
 
 		 929 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  46.11 
 
 		 958 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  44.26 
 
 		 989 aa  532  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  42.44 
 
 		 920 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  41.01 
 
 		 939 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  41.97 
 
 		 940 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  41.04 
 
 		 886 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  41.38 
 
 		 881 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  40.5 
 
 		 927 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  40.86 
 
 		 955 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  36.64 
 
 		 2417 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  42 
 
 		 2458 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  40.23 
 
 		 923 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  38.49 
 
 		 956 aa  416  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  39.24 
 
 		 922 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  35.34 
 
 		 944 aa  347  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  36.18 
 
 		 891 aa  346  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  35.08 
 
 		 942 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  35.48 
 
 		 928 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  34.94 
 
 		 893 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  32.07 
 
 		 2558 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  34.05 
 
 		 2698 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  32.03 
 
 		 2554 aa  293  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  33.43 
 
 		 2443 aa  258  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  31.54 
 
 		 2652 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  29.06 
 
 		 2534 aa  252  2e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  32.84 
 
 		 2510 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  31.46 
 
 		 2479 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  38 
 
 		 334 aa  145  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1126 aa  116  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 3320 aa  114  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.54 
 
 		 1976 aa  97.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  26.6 
 
 		 1338 aa  83.2  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.28 
 
 		 927 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  23.67 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1488 aa  82  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1140 aa  81.3  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.78 
 
 		 1464 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1834 aa  77.4  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  25.35 
 
 		 3456 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1620 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.43 
 
 		 482 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  30.32 
 
 		 1935 aa  72.4  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.78 
 
 		 1271 aa  71.6  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.28 
 
 		 1560 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  23.19 
 
 		 903 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1433 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  35.09 
 
 		 391 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  23.16 
 
 		 2035 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1147 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1600 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.55 
 
 		 1467 aa  68.6  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  35.65 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  35.65 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  35.65 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.8 
 
 		 2003 aa  68.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1352 aa  67.8  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  23.91 
 
 		 1573 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1959 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  38.24 
 
 		 1710 aa  67  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  30.11 
 
 		 598 aa  67  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  23.57 
 
 		 2017 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  23.17 
 
 		 2059 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  30.25 
 
 		 474 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 3193 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  30.48 
 
 		 1547 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  24.53 
 
 		 2076 aa  64.7  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  22.83 
 
 		 1362 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  35.29 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  35.48 
 
 		 1550 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  23.62 
 
 		 741 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.93 
 
 		 1586 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.14 
 
 		 1595 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  36.04 
 
 		 520 aa  64.3  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  23.01 
 
 		 605 aa  63.9  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.23 
 
 		 678 aa  63.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  31.82 
 
 		 284 aa  63.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1942 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  29.11 
 
 		 1892 aa  62.4  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  34.21 
 
 		 1551 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1917 aa  62  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 867 aa  62  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  34.21 
 
 		 583 aa  62  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.07 
 
 		 1572 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  33.61 
 
 		 1429 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  32.88 
 
 		 535 aa  61.2  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>