160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1597 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  99.5 
 
 
805 aa  1627    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  99.75 
 
 
807 aa  1561    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  99.53 
 
 
858 aa  1735    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  99.5 
 
 
800 aa  1617    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  99.65 
 
 
858 aa  1734    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  100 
 
 
858 aa  1740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  99.5 
 
 
800 aa  1617    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  43.17 
 
 
806 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  43.17 
 
 
806 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  42.67 
 
 
806 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  43.17 
 
 
806 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  43.17 
 
 
806 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  43.29 
 
 
806 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  43.17 
 
 
806 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  43.17 
 
 
806 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  55.51 
 
 
638 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  42.11 
 
 
1100 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  42.43 
 
 
1000 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  36.18 
 
 
1567 aa  428  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  46.2 
 
 
1222 aa  425  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  32.2 
 
 
918 aa  217  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  33.2 
 
 
593 aa  200  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  31.94 
 
 
781 aa  173  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  31.75 
 
 
781 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  31.24 
 
 
831 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  31.4 
 
 
797 aa  151  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  28.89 
 
 
759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  27.42 
 
 
947 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  27.42 
 
 
909 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  25.75 
 
 
517 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  26.23 
 
 
671 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  28.51 
 
 
757 aa  83.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  25.46 
 
 
672 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  29.76 
 
 
427 aa  73.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  30.07 
 
 
748 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  23.68 
 
 
644 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  33.06 
 
 
597 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  40 
 
 
497 aa  68.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  30.37 
 
 
436 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  26.18 
 
 
650 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.45 
 
 
476 aa  65.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.43 
 
 
1072 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  36.44 
 
 
652 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  32.58 
 
 
430 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  36.44 
 
 
652 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  30.4 
 
 
469 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  29.31 
 
 
957 aa  61.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  29.01 
 
 
484 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  29.35 
 
 
448 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  29.01 
 
 
558 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  29.85 
 
 
494 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  26.7 
 
 
474 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  27.41 
 
 
737 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  26.59 
 
 
450 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  27 
 
 
1207 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  34.83 
 
 
461 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  25.13 
 
 
653 aa  58.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  25.54 
 
 
2073 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  36.84 
 
 
1347 aa  57.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  28.57 
 
 
172 aa  57.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  28.99 
 
 
794 aa  57.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02420  glyoxal oxidase precursor, putative  26.25 
 
 
631 aa  57.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  31.47 
 
 
1148 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7940  hypothetical protein  21.95 
 
 
573 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  29.31 
 
 
884 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  30.77 
 
 
726 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  26.25 
 
 
1245 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.88 
 
 
489 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.71 
 
 
500 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  36.71 
 
 
468 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  25 
 
 
642 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  31.82 
 
 
380 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  30.33 
 
 
576 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  29.23 
 
 
374 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  27.47 
 
 
1016 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  32.2 
 
 
1259 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  30.83 
 
 
548 aa  54.7  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  29.69 
 
 
566 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  29.17 
 
 
495 aa  53.9  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  28.81 
 
 
489 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  34.43 
 
 
492 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  30.51 
 
 
634 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  32.1 
 
 
547 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  35.06 
 
 
801 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  29.08 
 
 
377 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  26.1 
 
 
586 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  29.81 
 
 
468 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  31.4 
 
 
451 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  28.21 
 
 
423 aa  52  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  29.1 
 
 
1049 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.03 
 
 
756 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  25.6 
 
 
366 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  26.71 
 
 
605 aa  51.2  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  32.58 
 
 
490 aa  51.2  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  30.83 
 
 
732 aa  51.2  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  37.66 
 
 
642 aa  50.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.82 
 
 
493 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  24.81 
 
 
646 aa  50.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  29.85 
 
 
414 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>