More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3951 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3951  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  831    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131979  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  57.24 
 
 
688 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.89 
 
 
566 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.38 
 
 
566 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.1 
 
 
675 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.3 
 
 
689 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.18 
 
 
688 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.89 
 
 
573 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  57.04 
 
 
688 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.09 
 
 
730 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.34 
 
 
670 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.86 
 
 
567 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.18 
 
 
567 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.45 
 
 
655 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  56.14 
 
 
656 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.79 
 
 
731 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.55 
 
 
562 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.22 
 
 
688 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  55.24 
 
 
656 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.83 
 
 
561 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  56.47 
 
 
563 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.24 
 
 
673 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.19 
 
 
563 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.03 
 
 
730 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  55.28 
 
 
566 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.94 
 
 
563 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.4 
 
 
563 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.12 
 
 
563 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.61 
 
 
674 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.12 
 
 
561 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  54.55 
 
 
565 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.68 
 
 
563 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  54.77 
 
 
691 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  53.67 
 
 
716 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.55 
 
 
672 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  55.48 
 
 
561 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.9 
 
 
563 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  52.7 
 
 
561 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.06 
 
 
561 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  53.66 
 
 
674 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  52.48 
 
 
714 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.74 
 
 
563 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.52 
 
 
563 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.59 
 
 
560 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.85 
 
 
656 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.06 
 
 
691 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.32 
 
 
587 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  54.58 
 
 
568 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  56 
 
 
542 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  53.87 
 
 
552 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  53.15 
 
 
565 aa  262  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  56.12 
 
 
563 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  53 
 
 
691 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.94 
 
 
450 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53 
 
 
565 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.54 
 
 
563 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  54.83 
 
 
602 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  53.71 
 
 
562 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.86 
 
 
568 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.47 
 
 
563 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.04 
 
 
564 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.36 
 
 
572 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  53.15 
 
 
566 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  54.48 
 
 
564 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.07 
 
 
741 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  52.45 
 
 
698 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.87 
 
 
449 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  53.55 
 
 
561 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  50.67 
 
 
676 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.23 
 
 
568 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.71 
 
 
698 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.53 
 
 
561 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.75 
 
 
694 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.45 
 
 
698 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  51.06 
 
 
568 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.75 
 
 
567 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.32 
 
 
667 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.71 
 
 
674 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  53.45 
 
 
556 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  52.45 
 
 
561 aa  246  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  56.47 
 
 
563 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.24 
 
 
560 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  52.72 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.3 
 
 
561 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.3 
 
 
566 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.81 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.45 
 
 
561 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  51.4 
 
 
577 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.71 
 
 
563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.84 
 
 
586 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  53.36 
 
 
707 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.68 
 
 
712 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.57 
 
 
681 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  53.36 
 
 
716 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.8 
 
 
681 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.61 
 
 
689 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.35 
 
 
711 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.15 
 
 
563 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  52.92 
 
 
559 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53 
 
 
561 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>