More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3879 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 260 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  79.15 
 
 		 313 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  78.76 
 
 		 312 aa  430  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  78.76 
 
 		 311 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  77.61 
 
 		 308 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  78.76 
 
 		 310 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  75.29 
 
 		 322 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  67.05 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  56.59 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  56.59 
 
 		 346 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  55.43 
 
 		 348 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  55.21 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  54.26 
 
 		 356 aa  278  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  39.73 
 
 		 439 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 		 430 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 427 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 		 440 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 393 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  38.77 
 
 		 439 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  41.41 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  38.05 
 
 		 297 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 428 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  40.99 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  39.91 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  39.45 
 
 		 293 aa  148  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  37.39 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  36.94 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  38.43 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 		 387 aa  99.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 352 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.14 
 
 		 373 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  33.7 
 
 		 373 aa  95.5  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 305 aa  95.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 		 372 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 		 1120 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  34.85 
 
 		 417 aa  93.6  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 1124 aa  92.4  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.5 
 
 		 468 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 503 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 302 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 199 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 277 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.65 
 
 		 1119 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.65 
 
 		 1115 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.65 
 
 		 1115 aa  85.1  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  26.73 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.65 
 
 		 1115 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  30.15 
 
 		 927 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  31.52 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 890 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.27 
 
 		 571 aa  82.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 898 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  29.7 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.9 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  29.41 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  29.65 
 
 		 872 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.1 
 
 		 1115 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  29.1 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 520 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 404 aa  78.6  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>