More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0462 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  53.01 
 
 
652 aa  702    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  100 
 
 
654 aa  1344    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  51.85 
 
 
712 aa  685    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  52.7 
 
 
685 aa  695    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  47.83 
 
 
691 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  46.81 
 
 
691 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  46.3 
 
 
685 aa  591  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  47.11 
 
 
709 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  47.5 
 
 
680 aa  571  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  34.71 
 
 
757 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 
760 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  38.53 
 
 
788 aa  355  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 
746 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  35.76 
 
 
747 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  33.48 
 
 
735 aa  342  9e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 
749 aa  339  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  35.82 
 
 
747 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 
745 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  33.92 
 
 
723 aa  326  8.000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  34.86 
 
 
804 aa  325  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  33.94 
 
 
768 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
772 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  32.96 
 
 
686 aa  316  9e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  35.73 
 
 
776 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 
774 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 
774 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  35.68 
 
 
747 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  31.98 
 
 
726 aa  288  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  33.69 
 
 
664 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  29.95 
 
 
649 aa  258  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  31.27 
 
 
677 aa  251  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  31.1 
 
 
653 aa  250  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  33.1 
 
 
680 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  29.27 
 
 
649 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  30.96 
 
 
655 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  28.72 
 
 
672 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  29.52 
 
 
679 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  30.19 
 
 
682 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  29.23 
 
 
673 aa  195  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  29.48 
 
 
716 aa  181  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  29.79 
 
 
677 aa  169  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  28.43 
 
 
808 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  32.77 
 
 
677 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  41.48 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  39.18 
 
 
645 aa  110  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  29.55 
 
 
663 aa  110  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  26.79 
 
 
616 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  30.32 
 
 
716 aa  106  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 
643 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  30.82 
 
 
650 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  41.96 
 
 
638 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  28.83 
 
 
590 aa  104  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  27.79 
 
 
592 aa  104  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  30.84 
 
 
593 aa  102  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  42.75 
 
 
669 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  30.52 
 
 
593 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  28.5 
 
 
608 aa  100  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  37.29 
 
 
649 aa  98.6  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  27.85 
 
 
763 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  35.53 
 
 
640 aa  97.8  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  28.74 
 
 
637 aa  97.8  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  42.21 
 
 
663 aa  97.8  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  29.28 
 
 
678 aa  97.4  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  31.38 
 
 
686 aa  97.1  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  36.91 
 
 
720 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  38.82 
 
 
690 aa  97.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  27.49 
 
 
750 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  28.43 
 
 
648 aa  96.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  27.49 
 
 
750 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  41.13 
 
 
628 aa  95.5  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 
748 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  27.1 
 
 
650 aa  95.1  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  40.82 
 
 
650 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  25.63 
 
 
715 aa  95.1  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  39.72 
 
 
653 aa  94.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  34.21 
 
 
637 aa  94.7  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  39.46 
 
 
642 aa  94  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  33.62 
 
 
830 aa  94  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  29.72 
 
 
657 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 
649 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  34.12 
 
 
747 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.46 
 
 
642 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  28.85 
 
 
650 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 
641 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  39.72 
 
 
707 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  39.33 
 
 
642 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 
660 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  42.55 
 
 
657 aa  92  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  38.06 
 
 
756 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  28 
 
 
750 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3877  lytic transglycosylase catalytic  34.67 
 
 
898 aa  92.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  42.55 
 
 
657 aa  91.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  29.53 
 
 
652 aa  91.3  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  33.78 
 
 
763 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  28.83 
 
 
661 aa  91.3  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  37.59 
 
 
690 aa  90.9  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 
659 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  28.67 
 
 
642 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  37.01 
 
 
660 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  38.97 
 
 
642 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>