More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3877 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3877  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 898 aa  1838    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  42.34 
 
 		 374 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  43.7 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  38.86 
 
 		 672 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 		 788 aa  99  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  40.31 
 
 		 776 aa  98.2  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 774 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 774 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  39.39 
 
 		 768 aa  96.3  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  40.46 
 
 		 760 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  40.46 
 
 		 757 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  41.09 
 
 		 664 aa  95.5  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  36.23 
 
 		 649 aa  94  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  40.82 
 
 		 682 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  40.54 
 
 		 749 aa  94  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  34.67 
 
 		 654 aa  92.4  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  42.97 
 
 		 195 aa  91.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  37.09 
 
 		 680 aa  92  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  35.61 
 
 		 746 aa  91.3  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  35.86 
 
 		 747 aa  91.3  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  40.54 
 
 		 735 aa  91.3  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  39.64 
 
 		 747 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1758  hypothetical protein  24.47 
 
 		 808 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000906053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  39.64 
 
 		 804 aa  90.1  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  37.75 
 
 		 685 aa  89.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 686 aa  88.2  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  36.04 
 
 		 745 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  32.47 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  30.77 
 
 		 653 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  38.53 
 
 		 726 aa  86.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  34.09 
 
 		 747 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  32.24 
 
 		 677 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  38.93 
 
 		 677 aa  85.9  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.33 
 
 		 652 aa  85.1  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 685 aa  85.1  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  34.67 
 
 		 691 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  35.26 
 
 		 716 aa  84.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  34.46 
 
 		 691 aa  83.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  34 
 
 		 712 aa  83.2  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 721 aa  82.8  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 		 645 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  34.76 
 
 		 756 aa  81.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  34.67 
 
 		 655 aa  81.3  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  35.44 
 
 		 723 aa  80.5  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35.77 
 
 		 638 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  31.29 
 
 		 698 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  33.33 
 
 		 709 aa  80.1  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 686 aa  77.8  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  35.11 
 
 		 637 aa  77.8  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 772 aa  77.4  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  38.06 
 
 		 187 aa  76.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 724 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  34.06 
 
 		 640 aa  77  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  33.99 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  35.42 
 
 		 719 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 642 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  37.67 
 
 		 187 aa  75.1  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 		 643 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  37.31 
 
 		 709 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  32.31 
 
 		 650 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  35.85 
 
 		 218 aa  74.3  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 750 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 750 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  37.31 
 
 		 709 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  34.78 
 
 		 747 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  33.7 
 
 		 750 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  33.82 
 
 		 673 aa  72.8  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 		 730 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  32.87 
 
 		 663 aa  72.8  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  31.88 
 
 		 641 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 		 730 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  34.55 
 
 		 649 aa  72  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 641 aa  72  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 641 aa  72  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.16 
 
 		 641 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  35.07 
 
 		 593 aa  70.9  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  31.88 
 
 		 641 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  34.35 
 
 		 642 aa  70.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  34.18 
 
 		 720 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  40.71 
 
 		 628 aa  70.1  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  36.04 
 
 		 643 aa  69.7  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  35.07 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  35.07 
 
 		 195 aa  70.1  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 650 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  30.43 
 
 		 648 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  32.3 
 
 		 677 aa  69.3  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 201 aa  69.3  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 650 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  29.93 
 
 		 808 aa  69.3  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  31.39 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  31.16 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  31.16 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  31.16 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 661 aa  68.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  31.16 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  36.61 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  33.56 
 
 		 655 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 643 aa  67.8  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  33.56 
 
 		 655 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>