144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3884 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3884  YD repeat protein  100 
 
 		 1879 aa  3773    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  64.84 
 
 		 2530 aa  127  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  27.46 
 
 		 764 aa  115  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  27.24 
 
 		 741 aa  113  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.54 
 
 		 788 aa  110  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.54 
 
 		 788 aa  110  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  27.03 
 
 		 705 aa  102  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.37 
 
 		 1381 aa  87.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  25.21 
 
 		 2076 aa  84  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  23.13 
 
 		 1976 aa  83.2  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  21.67 
 
 		 1271 aa  81.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1517 aa  78.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1433 aa  77  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3704  hypothetical protein  29.57 
 
 		 321 aa  76.3  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000166483  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.87 
 
 		 2350 aa  75.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.84 
 
 		 3073 aa  69.7  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  25.96 
 
 		 2191 aa  68.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.1 
 
 		 1840 aa  68.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  26.32 
 
 		 2961 aa  68.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 628 aa  66.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  23.95 
 
 		 3273 aa  66.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  23.55 
 
 		 869 aa  66.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0962  hypothetical protein  50.91 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  23.39 
 
 		 2294 aa  65.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  28.72 
 
 		 2387 aa  65.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.99 
 
 		 1467 aa  65.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  23.37 
 
 		 2017 aa  65.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1763 aa  63.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.03 
 
 		 2031 aa  63.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  23.95 
 
 		 2437 aa  61.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 2831 aa  62  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  23.47 
 
 		 2486 aa  61.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  27.03 
 
 		 2031 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.75 
 
 		 2032 aa  60.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 2007 aa  60.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1806 aa  60.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  23.64 
 
 		 2497 aa  59.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1825 aa  59.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1825 aa  59.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  25.51 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  25.24 
 
 		 2145 aa  59.3  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  30.08 
 
 		 2374 aa  59.3  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.26 
 
 		 1576 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.32 
 
 		 3027 aa  58.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 2003 aa  58.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1531 aa  58.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  39.25 
 
 		 520 aa  57.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  24.37 
 
 		 2413 aa  57.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  23.87 
 
 		 2401 aa  57.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  32.77 
 
 		 316 aa  57.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  26.98 
 
 		 1140 aa  57  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  22.4 
 
 		 1405 aa  57.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  22.89 
 
 		 2277 aa  57.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  24.64 
 
 		 2349 aa  56.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2324  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 765 aa  55.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.2713  decreased coverage  0.00718158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.47 
 
 		 1259 aa  55.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1319 aa  55.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.63 
 
 		 1464 aa  55.5  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.13 
 
 		 1518 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.79 
 
 		 1917 aa  55.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.67 
 
 		 482 aa  55.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  32.76 
 
 		 298 aa  55.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  32.76 
 
 		 298 aa  55.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  24.39 
 
 		 738 aa  55.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  27.14 
 
 		 474 aa  54.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2322  YD repeat-containing protein  27.88 
 
 		 730 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505225  decreased coverage  0.0077157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1157 aa  54.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.41 
 
 		 1352 aa  53.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.57 
 
 		 2035 aa  53.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  34.35 
 
 		 311 aa  53.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.23 
 
 		 1508 aa  53.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  24.07 
 
 		 902 aa  53.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  25.24 
 
 		 2290 aa  53.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.74 
 
 		 1489 aa  53.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.86 
 
 		 1572 aa  52.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 2283 aa  52.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  26.18 
 
 		 605 aa  52.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  22.94 
 
 		 678 aa  52.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  24.52 
 
 		 1953 aa  52.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  22.03 
 
 		 2942 aa  52.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.46 
 
 		 927 aa  52  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  23.33 
 
 		 2138 aa  51.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  26.82 
 
 		 3333 aa  51.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  24.39 
 
 		 917 aa  51.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  27.61 
 
 		 1710 aa  51.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.61 
 
 		 2731 aa  50.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  25.36 
 
 		 2658 aa  50.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1586 aa  50.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  22.93 
 
 		 1419 aa  50.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25.44 
 
 		 1679 aa  50.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  36.11 
 
 		 391 aa  50.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  23.73 
 
 		 903 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  25.72 
 
 		 3689 aa  50.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.44 
 
 		 2149 aa  49.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  32.41 
 
 		 722 aa  50.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  24.6 
 
 		 1673 aa  49.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1753 aa  49.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.47 
 
 		 1586 aa  48.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  25.4 
 
 		 2447 aa  48.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  21.79 
 
 		 1942 aa  48.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>