191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0676 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  73.56 
 
 		 182 aa  248  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  63.87 
 
 		 186 aa  238  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  63.44 
 
 		 186 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  60.87 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  63.59 
 
 		 194 aa  205  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  59.34 
 
 		 182 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  58.47 
 
 		 187 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  58.1 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3102  regulatory protein TetR  58.15 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0043  transcriptional regulator, TetR family  44.92 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3845  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  28.82 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  24.19 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  35.06 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  36.72 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  27.47 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  25.42 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  22.8 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1648  hypothetical protein  21.74 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  31.13 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0039  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 242 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  29.37 
 
 		 219 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  39.66 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  45.28 
 
 		 234 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0220  regulatory protein, TetR  30.06 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 251 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 201 aa  44.7  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  29.27 
 
 		 246 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  43.1 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  18.75 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>