More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0776 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0776  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 662 aa  1357    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0702  NAD-dependent DNA ligase  52.8 
 
 		 677 aa  717    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0301  DNA ligase, NAD-dependent  53.67 
 
 		 676 aa  724    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.10932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  46.76 
 
 		 715 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0939  DNA ligase (NAD+)  48.19 
 
 		 698 aa  579  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2432  DNA ligase, NAD-dependent  48.97 
 
 		 710 aa  575  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3381  DNA ligase, NAD-dependent  46.26 
 
 		 714 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113379  hitchhiker  0.00670333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1290  DNA ligase, NAD-dependent  46.01 
 
 		 714 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  45.94 
 
 		 700 aa  566  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0937  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.75 
 
 		 717 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0205713  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  45.64 
 
 		 699 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1062  NAD-dependent DNA ligase  45.59 
 
 		 716 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759691  normal  0.781607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  46.12 
 
 		 714 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3160  DNA ligase, NAD-dependent  43.95 
 
 		 708 aa  555  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.780726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1159  DNA ligase, NAD-dependent  45.89 
 
 		 704 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.227634  normal  0.637978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6162  DNA ligase (polydeoxyribonucleotide synthase (NAD+))  44.57 
 
 		 716 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825564 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4083  DNA ligase, NAD-dependent  43.37 
 
 		 765 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316882  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1280  DNA ligase, NAD-dependent  45.99 
 
 		 704 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.334632 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0500  DNA ligase, NAD-dependent  46 
 
 		 670 aa  546  1e-154  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.147098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3071  DNA ligase, NAD-dependent  46.23 
 
 		 704 aa  545  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2622  DNA ligase  46.19 
 
 		 704 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.477478  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1762  DNA ligase, NAD-dependent  44.44 
 
 		 720 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654069  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2066  DNA ligase, NAD-dependent  45.74 
 
 		 701 aa  539  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1509  DNA ligase  44.53 
 
 		 741 aa  538  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75863  normal  0.655718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  43.81 
 
 		 673 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1997  DNA ligase, NAD-dependent  45.68 
 
 		 703 aa  537  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2579  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.79 
 
 		 718 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1420  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.08 
 
 		 719 aa  527  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2840  NAD-dependent DNA ligase LigA  44 
 
 		 718 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229062  normal  0.0102416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1376  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.08 
 
 		 719 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390799  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1754  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.71 
 
 		 721 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2070  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.57 
 
 		 717 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2876  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.84 
 
 		 719 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0956415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2504  DNA ligase, NAD-dependent  43.41 
 
 		 752 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.234774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1738  DNA ligase, NAD-dependent  41.94 
 
 		 721 aa  514  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00107521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  44.1 
 
 		 672 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0757  DNA ligase, NAD-dependent  45.75 
 
 		 682 aa  510  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  42.77 
 
 		 691 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  42.63 
 
 		 691 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1398  DNA ligase, NAD-dependent  42.92 
 
 		 739 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.695979 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  42.77 
 
 		 746 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  42.77 
 
 		 683 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  42.77 
 
 		 691 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4727  DNA ligase, NAD-dependent  42.84 
 
 		 708 aa  502  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  43.45 
 
 		 672 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.22 
 
 		 670 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  42.48 
 
 		 691 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.21 
 
 		 671 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.21 
 
 		 671 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.06 
 
 		 671 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  41.88 
 
 		 707 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  42.1 
 
 		 691 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  43.52 
 
 		 682 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  43.03 
 
 		 674 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  42.21 
 
 		 671 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  42.62 
 
 		 690 aa  495  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  42.54 
 
 		 673 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  42.33 
 
 		 691 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  42.21 
 
 		 671 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 672 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.21 
 
 		 671 aa  492  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  41.7 
 
 		 691 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  41.7 
 
 		 691 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.21 
 
 		 671 aa  491  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  42.88 
 
 		 668 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.64 
 
 		 670 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  41.7 
 
 		 691 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.79 
 
 		 670 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.79 
 
 		 670 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  42.22 
 
 		 683 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  42.18 
 
 		 691 aa  492  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  42.3 
 
 		 677 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  41.38 
 
 		 726 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  41.7 
 
 		 691 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.21 
 
 		 671 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.21 
 
 		 671 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  41.7 
 
 		 691 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  41.7 
 
 		 691 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  41.4 
 
 		 697 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  41.7 
 
 		 691 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.69 
 
 		 669 aa  488  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  42.43 
 
 		 668 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.06 
 
 		 671 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  42.73 
 
 		 672 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.06 
 
 		 671 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.06 
 
 		 671 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.99 
 
 		 681 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.54 
 
 		 673 aa  484  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  41.26 
 
 		 694 aa  485  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.06 
 
 		 671 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  42.6 
 
 		 670 aa  481  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.3 
 
 		 669 aa  481  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.2 
 
 		 671 aa  480  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  42 
 
 		 675 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  41.31 
 
 		 718 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.69 
 
 		 681 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  41.26 
 
 		 670 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  41.6 
 
 		 711 aa  479  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  41.39 
 
 		 688 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  41.46 
 
 		 671 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>