More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06539 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  62.25 
 
 		 211 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  40.89 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 232 aa  154  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  35.78 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 106 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  43.06 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  24.57 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0088  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
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NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  32.53 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 372 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 275 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  27.66 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  23.65 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  35.37 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  34.78 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  46.94 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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