More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0591 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  100 
 
 
813 aa  1589    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.42 
 
 
1019 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.16 
 
 
588 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  46.77 
 
 
1022 aa  194  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  46.77 
 
 
1017 aa  194  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  44.19 
 
 
1055 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  46.61 
 
 
1175 aa  185  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.4 
 
 
1118 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  54.92 
 
 
709 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.09 
 
 
1113 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.1 
 
 
1222 aa  178  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.16 
 
 
1340 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  43.02 
 
 
1037 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.84 
 
 
1009 aa  172  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.63 
 
 
2194 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.54 
 
 
3427 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  32.25 
 
 
917 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.31 
 
 
1225 aa  165  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.21 
 
 
891 aa  163  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  45.66 
 
 
709 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.5 
 
 
1838 aa  162  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  45.91 
 
 
652 aa  161  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.12 
 
 
889 aa  154  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  34.36 
 
 
412 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.59 
 
 
1012 aa  150  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  47.47 
 
 
3619 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  47 
 
 
3619 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.26 
 
 
1963 aa  145  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  30.53 
 
 
872 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  42.21 
 
 
1164 aa  142  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.68 
 
 
1236 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  41.16 
 
 
946 aa  141  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.6 
 
 
547 aa  141  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  47.09 
 
 
5171 aa  140  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.08 
 
 
2667 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.71 
 
 
1795 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  51.68 
 
 
950 aa  137  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  30.28 
 
 
386 aa  135  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  48.59 
 
 
421 aa  135  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  47.74 
 
 
260 aa  134  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.17 
 
 
1424 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  31.81 
 
 
1490 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.04 
 
 
938 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  34.75 
 
 
604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  31.65 
 
 
1126 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  48.31 
 
 
1197 aa  131  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  49.13 
 
 
2954 aa  131  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40 
 
 
1372 aa  130  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 
615 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  46.55 
 
 
2105 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.98 
 
 
1279 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  33.95 
 
 
424 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  39.17 
 
 
833 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  52.08 
 
 
867 aa  128  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  41.62 
 
 
639 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  51.39 
 
 
2885 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.09 
 
 
2807 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  48.51 
 
 
3608 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  35 
 
 
460 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  39.9 
 
 
1346 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  31.83 
 
 
1557 aa  125  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  43.56 
 
 
1287 aa  124  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  47.73 
 
 
243 aa  124  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  44.67 
 
 
850 aa  124  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  47.95 
 
 
3954 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.81 
 
 
2668 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  30.95 
 
 
644 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  40.36 
 
 
589 aa  121  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  43.4 
 
 
1895 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  38.94 
 
 
686 aa  121  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.86 
 
 
980 aa  121  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  41.38 
 
 
606 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.37 
 
 
1534 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  39.26 
 
 
940 aa  120  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  38.89 
 
 
757 aa  120  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  49.41 
 
 
982 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  47.65 
 
 
202 aa  119  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  47.65 
 
 
202 aa  119  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  40.62 
 
 
2145 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.5 
 
 
1532 aa  118  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  38.35 
 
 
467 aa  118  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  46.24 
 
 
595 aa  117  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.45 
 
 
485 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 
686 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.63 
 
 
1180 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  37.13 
 
 
437 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  32.24 
 
 
554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  54.74 
 
 
280 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  44.86 
 
 
491 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  37.74 
 
 
3209 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  43.54 
 
 
1079 aa  115  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  46.29 
 
 
4334 aa  114  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  54.01 
 
 
280 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  40.83 
 
 
9867 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  43.93 
 
 
355 aa  114  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  36.71 
 
 
437 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  41.15 
 
 
1383 aa  114  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  28.86 
 
 
4379 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  33.94 
 
 
1275 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  39.32 
 
 
526 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>