More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0797 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 
1141 aa  2202    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  39.03 
 
 
2567 aa  280  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  39.05 
 
 
2127 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  34.18 
 
 
4854 aa  213  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  31.81 
 
 
5020 aa  211  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.62 
 
 
2812 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.54 
 
 
2239 aa  199  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.68 
 
 
14916 aa  182  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  29.16 
 
 
2743 aa  173  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.99 
 
 
1884 aa  172  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.82 
 
 
4978 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  35.13 
 
 
3439 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  29.22 
 
 
5745 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  36.47 
 
 
5094 aa  157  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  29.43 
 
 
3758 aa  154  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  29.08 
 
 
2555 aa  154  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  46.15 
 
 
1538 aa  148  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  31.27 
 
 
1206 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  28.14 
 
 
3191 aa  135  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.96 
 
 
1706 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  26.39 
 
 
1883 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.01 
 
 
1597 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  30.61 
 
 
3927 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  27.44 
 
 
2784 aa  119  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  29.84 
 
 
4285 aa  115  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  30.46 
 
 
1867 aa  115  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  28.53 
 
 
3229 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.98 
 
 
1553 aa  108  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.53 
 
 
2067 aa  106  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  48.63 
 
 
2329 aa  105  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.97 
 
 
6678 aa  105  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.52 
 
 
1599 aa  102  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  27.37 
 
 
1512 aa  102  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  26.81 
 
 
16311 aa  101  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  26.27 
 
 
2767 aa  101  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  25.64 
 
 
3714 aa  100  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  27.89 
 
 
3259 aa  93.2  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  26.7 
 
 
2074 aa  90.9  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  27.17 
 
 
892 aa  91.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  28.03 
 
 
7284 aa  90.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.96 
 
 
4836 aa  88.6  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  25.81 
 
 
4661 aa  88.2  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.25 
 
 
5098 aa  86.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  36.14 
 
 
2816 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  26.79 
 
 
1428 aa  86.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  27.3 
 
 
1269 aa  85.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.15 
 
 
11716 aa  85.5  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  25.64 
 
 
3508 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  23.93 
 
 
3182 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  40.54 
 
 
4334 aa  82  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  28.41 
 
 
1268 aa  81.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.81 
 
 
369 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  25.39 
 
 
2839 aa  80.1  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.67 
 
 
4848 aa  79.7  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  28.59 
 
 
1269 aa  78.2  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  41.9 
 
 
2542 aa  77.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  26.89 
 
 
2377 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  37.87 
 
 
2537 aa  77  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.61 
 
 
4798 aa  76.3  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  40.48 
 
 
824 aa  76.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.01 
 
 
2507 aa  76.3  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  26.43 
 
 
16322 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  48.67 
 
 
3091 aa  74.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  43.69 
 
 
5769 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.09 
 
 
3363 aa  72  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  26.58 
 
 
2353 aa  71.6  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  36.77 
 
 
1855 aa  71.6  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  41.3 
 
 
1232 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.53 
 
 
2807 aa  71.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.48 
 
 
3816 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  36.88 
 
 
4687 aa  70.1  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.8 
 
 
994 aa  70.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.08 
 
 
850 aa  69.3  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  38.58 
 
 
974 aa  68.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  28.75 
 
 
3474 aa  68.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  37.8 
 
 
814 aa  67.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  37.97 
 
 
3314 aa  67  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  37.41 
 
 
2836 aa  66.6  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  40.35 
 
 
1750 aa  67.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  47.57 
 
 
2336 aa  65.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  26.99 
 
 
1416 aa  65.1  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.49 
 
 
1109 aa  65.1  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  41.98 
 
 
4231 aa  64.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 
795 aa  64.3  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.63 
 
 
980 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.68 
 
 
3038 aa  63.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  32.88 
 
 
2296 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  35.17 
 
 
942 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  35.96 
 
 
4800 aa  63.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  33.14 
 
 
6006 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  29.71 
 
 
1502 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  29.3 
 
 
1215 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.28 
 
 
2689 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.07 
 
 
2812 aa  63.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  22.37 
 
 
2421 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  46.81 
 
 
2145 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  32.32 
 
 
721 aa  62.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.12 
 
 
1066 aa  62.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  48.68 
 
 
1383 aa  62.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.71 
 
 
1963 aa  62.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>