Gene Sdel_0797 details

Gene Information

• Locus tag: Sdel_0797
• ID: 8592331
• Type: CDS
• Is gene spliced: No
• Is pseudo gene: No
• Organism name: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946
• Kingdom: Bacteria
• Replicon accession: NC_013512
• Strand: +
• Start bp: 793029
• End bp: 796454
• Gene Length: 3426 bp
• Protein Length: 1141 aa
• Translation table: 11
• GC content: 43%
• Product: outer membrane adhesin like proteiin
• Protein accession: YP_003303863
• Protein GI: 268679432

Plasmid Coverage information

• Num covering plasmid clones: 0
• Plasmid unclonability p-value: 0.0000422857
• Plasmid hitchhiking: No
• Plasmid clonability: unclonable

Fosmid Coverage information

• Num covering fosmid clones: n/a
• Fosmid unclonability p-value: n/a
• Fosmid Hitchhiker: n/a
• Fosmid clonability: n/a

Sequence

Gene sequence

GTGATTCTTG CTTTGATGGA CGGGAAAGAG ATAACCCTAG CGGGCAATGA TGATATTTTC 
TTAGATAAAA GCGTTTATGT CGCTGAAGGA TTTGGGGAAG AAGCCGTCGT TTCTAGCCAA 
ACGGTCGGTG ATGTGATGTC TGGAAAGAGT GTTGAAGAGA TGCAGGCTGC GCTTTTAAGA 
GGTGAAGATG TTAGTGAGCT TGAAGCGACT GCTGCGGGAG AGGGTGGTGC ACCTGTGGGG 
GGTGAGATGT CAACCAATGC GATGGCACGT TACCTTACAG GAGGTAGTGA GAGTAATGTC 
GTAGCGGATT ATCGTACTCT TGACGTAGGT ACGGGTGAGG ATGTCACATA TGTTCCTCCC 
ACAGCACCTC TTGAAGAAGC TGCTACGGTT GTCGTTGCAA ACAGTGCGCC ATTAGCAGGG 
GATGATAGTG TTGTCACCAA TGAGGATACA CCTCTTTTAG GGACACTACC TTTGGCCACA 
GATGTGGATG GTGATGCCAT TACTTATGCG TTGGTAGGAG GTACGACTTC TGGAACGGTT 
GTTCTTAATG ACAATGGAGG CTATACCTAT ACCCCCAATG CCAATTATCA CGGTGGAGAT 
TCTTTTACAT ACAGTGTCAC CGATAGTAAT GGTGCGAGTA ATACGTATAC CGTTTCGATT 
GATGTTTTAC CTATCAATGA CACGCCAATA CTGGGCAGTG CCGTAGTTGG TTTGGATGAA 
ACCGATGTGA TCTTAAGTAC GGGTGGAACC CTTAGTGGTG TGGTTGATCC TGATGCAGGT 
GAAAACGCTT ACGTTGCTCA AAGTAATGTT GGAGGAACCT ATGGTGTCTT TAATTTAGCC 
ACGGATGGTA CATGGAGCTA TGTGGCAAAC GCCGCTTACA ATGAACTTAA CGCCGGCGAT 
GTGATTAGTG ATACCTTTAT CATTAAAAGT GTGGATGGAA CGGTTGATAG CAGTGTACAA 
GTGAGCATCA CCGGTACCAA TGATACCCCT GTTTTAGGCA GTGCTATTGT AGGACTTAAT 
GAAACCGATG TGATCTTAAG TACGGGTGGA AACCTTGGTG GGGTGGTTGA TCCTGATGCA 
GGTGAAAACG CTTACGTTGC TCAAAGTAAT GTTGGAGGAA CCTATGGTGT CTTTAATTTA 
GCCACGGATG GTACATGGAG CTATGTGGCA AACGCCGCTT ACAATGAACT TAACGCCGGC 
GATGTGATTA GTGATACCTT TATCATTAAA AGTGTGGATG GAACGGTTGA TAGCAGTGTA 
CAAGTGAGCA TCACCGGTAC CAATGATACG CCAGTTTTAG GCAGTGCTAT TGTAGGACTT 
AATGAAACTG ATGTGATCTT AAGTACGGGT GGAAACCTTG GTGGGGTGGT TGATCCTGAT 
GCAGGTGAAA ACGCTTACGT TGCTCAAAGT AATGTTGGAG GAACCTATGG TGTCTTTAAT 
TTAGCCACGG ATGGTACATG GAGCTATGTG GCAAACGCCG CTTACAATGA ACTTAACGCC 
GGCGATGTGA TTAGTGATAC CTTTATCATT AAAAGTGTCG ATGGAACGGT TGATAGCAGT 
GTACAAGTGA GCATCACCGG TACCAATGAT ACCCCTGTTT TAGGCAGTGC TATTGTAGGA 
CTTAATGAAA CCGATGTGAT CTTAAGTACG GGTGGAAACC TTGGTGGGGT GGTTGATCCT 
GATGCAGGTG AAAACGCTTA CGTTGCTCAA AGTAATGTTG GAGGAACCTA TGGTGTCTTT 
AATTTAGCCA CGGATGGTAC ATGGAGCTAT GTGGCAAACG CCGCTTACAA TGAACTTAAC 
GCTGGTGATG TGATTAGTGA TACCTTTATC ATTAAAAGTG TGGATGGAAC GGTTGATAGC 
AGTGTGCAAG TGAGTATCAC CGGTACCAAT GACACGCCTG TGGCTTCTTA CCATGAATTT 
ACAACCGCTG AGGATACTGC CATTACCCTT ACGGATGCGC AATTATTGAT AGGTTCAAGT 
GATATTGACG CAAACGATGT TTTAAGCATT GATAATGTAG CGCTCAAAGA TCCAGCCAAT 
GGAACGTTAA TCAGTAATGG TGATGGAACG TATACGTTTA ATCCTTCACA TAATTACAGT 
GGTAGTGCTA TTGAGCTTAG TTATACGCTG ACAGATACGA GTGGGGCAAC CAGTACGCAA 
GATGTGATGA TTCATGTAAC ACCTGTTGCA GATGCGCCGT TGCTTCAAAC CAGTGTGCTA 
CAAGGTGATG TCAGTTATGG TACTGAGTAC GAAGCTCCTG TGTTTAACGG TCATTTAAAT 
GCTGGCTCAA CAACGGGAAA TATTCTTTTT AATGGTTATA CAAAGCAAGC AATCATTGAC 
ATCAAGAGTT ATAAAACTTC TGTGGATGAA GGACGTATAG TCTTTTTAAG AGATGGCGAA 
TTCGTCAAAG AATTCTTGAT GGATACGTTG TTACCTACCG CTAATAATCA GTCTATACAG 
CTTGTTTTGG ATTCGGATGA GTATTTTAAC ATGGTGCGTA TCGACAATTT TGCGGACGGT 
AGTGATAAAA ACGCAGAGTT TAAGGTTGAT AGTGTGAGTT TGGTAGCGCC TATTACCGTA 
GAGTATCTTC TCAATATCGA TGCCGCACTG AGTGATAGCA GTGAAATGTT AACGCCTGTT 
ATGATTGAAA AAGCATCATT ACCTGATGGA GCAAGCCTTT ATGAAAACGG TGTGGTGGTG 
TATGACGTTG ACAATGATGG CTACTATGTT GTTGACCCAG ATGCAGAGAT TACGTTTACG 
ACAGATCGTT ATATAGGGGT GGATGAAATT AATGCCATTA GTAGTAGCGT TACCTCTTGG 
GATGGTGCAG ATTCCGCGAC AACAACGCAA AGTTCCTATA ATGAAATCTC GGGAACATTG 
GGCGATGATA CGTTATCTGG AACCGAAGGT GATGATTTAC TCAGTGGTAA TGATGGAAAT 
GATAGCCTAA GTGGTGGTTT GGGTGATGAT TTTCTTGATG GAGATGAAGG GGTAGATGCT 
CTTTATGGTG GTGTAGATGA TGATGTCTTA GTCTATGATA GCGCTGATAG CCAAATAGAT 
GGCGGTGATG GATTAGATAC ACTATTGGTT GGGGATTCGA ATATTGATTT CAATCTAATT 
GATGATGCAA AACTAGAAAA TATTGAAGTG ATTGACCTCT CAAGAGCAGA TGTGTCCATT 
ACCAATTTGA ATCCACAAGA CGTCTTTGAC ATGACGGACG ATACCAGTAC CATTTTGAAA 
ATTATAGGAG ATAGCAGTGA TGCTGTTGCC AGTACGATTA TTGCAGGGGA AGATTCACCA 
TGGAATGTCT CTGCGGATCA AACAGGTGTT GATGAAGGTT TTGTACGTTA TGAGGGTGCA 
CTGCCAGATA GCACACCTGT ATATATTGAT GTACAAGATA GCATTGTTCA TACTGATTTT 
GATTAA 

 

Protein sequence

MILALMDGKE ITLAGNDDIF LDKSVYVAEG FGEEAVVSSQ TVGDVMSGKS VEEMQAALLR 
GEDVSELEAT AAGEGGAPVG GEMSTNAMAR YLTGGSESNV VADYRTLDVG TGEDVTYVPP 
TAPLEEAATV VVANSAPLAG DDSVVTNEDT PLLGTLPLAT DVDGDAITYA LVGGTTSGTV 
VLNDNGGYTY TPNANYHGGD SFTYSVTDSN GASNTYTVSI DVLPINDTPI LGSAVVGLDE 
TDVILSTGGT LSGVVDPDAG ENAYVAQSNV GGTYGVFNLA TDGTWSYVAN AAYNELNAGD 
VISDTFIIKS VDGTVDSSVQ VSITGTNDTP VLGSAIVGLN ETDVILSTGG NLGGVVDPDA 
GENAYVAQSN VGGTYGVFNL ATDGTWSYVA NAAYNELNAG DVISDTFIIK SVDGTVDSSV 
QVSITGTNDT PVLGSAIVGL NETDVILSTG GNLGGVVDPD AGENAYVAQS NVGGTYGVFN 
LATDGTWSYV ANAAYNELNA GDVISDTFII KSVDGTVDSS VQVSITGTND TPVLGSAIVG 
LNETDVILST GGNLGGVVDP DAGENAYVAQ SNVGGTYGVF NLATDGTWSY VANAAYNELN 
AGDVISDTFI IKSVDGTVDS SVQVSITGTN DTPVASYHEF TTAEDTAITL TDAQLLIGSS 
DIDANDVLSI DNVALKDPAN GTLISNGDGT YTFNPSHNYS GSAIELSYTL TDTSGATSTQ 
DVMIHVTPVA DAPLLQTSVL QGDVSYGTEY EAPVFNGHLN AGSTTGNILF NGYTKQAIID 
IKSYKTSVDE GRIVFLRDGE FVKEFLMDTL LPTANNQSIQ LVLDSDEYFN MVRIDNFADG 
SDKNAEFKVD SVSLVAPITV EYLLNIDAAL SDSSEMLTPV MIEKASLPDG ASLYENGVVV 
YDVDNDGYYV VDPDAEITFT TDRYIGVDEI NAISSSVTSW DGADSATTTQ SSYNEISGTL 
GDDTLSGTEG DDLLSGNDGN DSLSGGLGDD FLDGDEGVDA LYGGVDDDVL VYDSADSQID 
GGDGLDTLLV GDSNIDFNLI DDAKLENIEV IDLSRADVSI TNLNPQDVFD MTDDTSTILK 
IIGDSSDAVA STIIAGEDSP WNVSADQTGV DEGFVRYEGA LPDSTPVYID VQDSIVHTDF 
D