More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3267 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 202 aa  226  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 188 aa  222  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 203 aa  191  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  42.47 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  39.25 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  31.22 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5422  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 335 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  29.82 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  29.93 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  32.91 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  31.46 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4374  regulatory protein TetR  39.39 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.985055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 307 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  24.14 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  38.75 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 227 aa  51.6  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 209 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  38.6 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 291 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 242 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 324 aa  51.2  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  39.29 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 438 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>