More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1126 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  100 
 
 
367 aa  765  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  38.76 
 
 
353 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  31.47 
 
 
421 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  38.7 
 
 
251 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  31.14 
 
 
354 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  31.14 
 
 
354 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  32.02 
 
 
359 aa  149  1e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  29.32 
 
 
387 aa  147  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  37.35 
 
 
429 aa  148  2e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  32.04 
 
 
412 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  37.4 
 
 
401 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  32.87 
 
 
404 aa  141  2e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  28.49 
 
 
387 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  33.94 
 
 
275 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  35 
 
 
402 aa  136  7e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.73566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  31.53 
 
 
337 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  27.03 
 
 
387 aa  133  4e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  27.03 
 
 
387 aa  133  4e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  32.08 
 
 
334 aa  133  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  45.86 
 
 
172 aa  132  1e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  33.56 
 
 
329 aa  130  4e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  45.45 
 
 
159 aa  128  2e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  28.23 
 
 
387 aa  127  4e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  8.19042e-09 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  31.46 
 
 
393 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  29 
 
 
365 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  31.76 
 
 
397 aa  121  2e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  31.13 
 
 
384 aa  121  2e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.99 
 
 
397 aa  121  2e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  27.15 
 
 
337 aa  120  4e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  30.32 
 
 
324 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  28.01 
 
 
343 aa  118  1e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  42.24 
 
 
188 aa  118  1e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  28.19 
 
 
386 aa  119  1e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  32.8 
 
 
331 aa  118  2e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  27.83 
 
 
384 aa  118  2e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  32.8 
 
 
331 aa  118  2e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  35.58 
 
 
222 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  36.32 
 
 
407 aa  116  8e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  30.67 
 
 
411 aa  115  9e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  34.09 
 
 
388 aa  114  4e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  28.99 
 
 
362 aa  112  8e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  29.35 
 
 
380 aa  112  8e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  24.44 
 
 
387 aa  112  8e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  31.12 
 
 
375 aa  111  2e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  31.03 
 
 
336 aa  111  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  33.78 
 
 
330 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  31.53 
 
 
384 aa  110  4e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  30.84 
 
 
425 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  34.64 
 
 
387 aa  109  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  30.42 
 
 
331 aa  109  7e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  27.67 
 
 
349 aa  109  9e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  31.01 
 
 
374 aa  109  9e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  28.34 
 
 
337 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.14 
 
 
379 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.71 
 
 
400 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  9.71423e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  30.62 
 
 
374 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  29.37 
 
 
392 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  28.48 
 
 
339 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  33.64 
 
 
338 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  31.56 
 
 
413 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  28.47 
 
 
340 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  28.22 
 
 
276 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  28.87 
 
 
328 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  34.56 
 
 
335 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  29.84 
 
 
386 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  28.62 
 
 
339 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  32.46 
 
 
374 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  28.32 
 
 
327 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  27.64 
 
 
338 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  30.77 
 
 
334 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  31.6 
 
 
347 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  27.68 
 
 
395 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  28.01 
 
 
363 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  27.57 
 
 
482 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  30.34 
 
 
351 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  29.59 
 
 
356 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  29.26 
 
 
352 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  28.42 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  36.84 
 
 
398 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  25.86 
 
 
341 aa  99.4  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  34.1 
 
 
381 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  29.52 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.58235e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  30.3 
 
 
417 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  28.78 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  26.58 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  32.88 
 
 
354 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  26.91 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  29.59 
 
 
351 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  31.02 
 
 
375 aa  96.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  31.05 
 
 
332 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  27.48 
 
 
380 aa  96.3  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.11 
 
 
385 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  28.77 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  32.72 
 
 
318 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  27.01 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  29.49 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  28.77 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  28.21 
 
 
428 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.24 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  32.13 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  6.56425e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>