176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0556 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  100 
 
 		 764 aa  1448    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.28 
 
 		 2911 aa  301  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  31.98 
 
 		 1628 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  34.75 
 
 		 2097 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  35.56 
 
 		 4800 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  38.8 
 
 		 1079 aa  186  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  30.86 
 
 		 1072 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  33.56 
 
 		 1582 aa  185  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  36.42 
 
 		 833 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.01 
 
 		 1390 aa  179  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.51 
 
 		 1145 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  31.81 
 
 		 1213 aa  165  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  32.9 
 
 		 1884 aa  147  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.32 
 
 		 2678 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.38 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  34.28 
 
 		 1112 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  32.37 
 
 		 1544 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  28.34 
 
 		 1112 aa  130  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  31.47 
 
 		 1286 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  28.26 
 
 		 2836 aa  125  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  27.19 
 
 		 745 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  37.94 
 
 		 2950 aa  111  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  26.03 
 
 		 1134 aa  103  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  46.91 
 
 		 759 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  29.96 
 
 		 2775 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  26.64 
 
 		 1363 aa  97.4  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  29.25 
 
 		 795 aa  96.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  33.72 
 
 		 648 aa  95.9  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.03 
 
 		 1236 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  29.21 
 
 		 3954 aa  93.2  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.43 
 
 		 1415 aa  88.6  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  27.29 
 
 		 1400 aa  87.4  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  26.45 
 
 		 1133 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  29.98 
 
 		 946 aa  86.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  31.6 
 
 		 574 aa  85.9  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  25.72 
 
 		 1764 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  25.78 
 
 		 1864 aa  84.3  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  25.95 
 
 		 2467 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1424 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  28.16 
 
 		 1534 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  27.66 
 
 		 4334 aa  81.6  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  29.19 
 
 		 1895 aa  80.9  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  31.96 
 
 		 2667 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  28.86 
 
 		 1279 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.12 
 
 		 2954 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  29.45 
 
 		 589 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.03 
 
 		 2807 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  29.81 
 
 		 1855 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  33.08 
 
 		 1610 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  28.12 
 
 		 860 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  29 
 
 		 1532 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  28.91 
 
 		 907 aa  71.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  31.01 
 
 		 1164 aa  70.9  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  27.82 
 
 		 12741 aa  70.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  30.17 
 
 		 559 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  26.72 
 
 		 851 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  31.39 
 
 		 2887 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  29.15 
 
 		 820 aa  70.1  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  46.24 
 
 		 1971 aa  67.8  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  47.31 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  25.55 
 
 		 595 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  27.82 
 
 		 15831 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  30.81 
 
 		 1557 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  29.53 
 
 		 2567 aa  65.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  26.96 
 
 		 2133 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  26.34 
 
 		 965 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  28.13 
 
 		 4687 aa  65.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  28.6 
 
 		 824 aa  65.1  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  31.5 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 		 1795 aa  64.7  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  27.56 
 
 		 959 aa  64.7  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.52 
 
 		 3427 aa  64.3  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  32.02 
 
 		 1610 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  28.19 
 
 		 2198 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  29.3 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  29.3 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  30.38 
 
 		 3619 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  30.56 
 
 		 1712 aa  61.6  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  30.61 
 
 		 2105 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  33.52 
 
 		 3587 aa  60.8  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  33.33 
 
 		 1883 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4160  VCBS  28.66 
 
 		 6581 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.530259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 		 2885 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  29.76 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  31.56 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  32.64 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  27.95 
 
 		 3619 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  27.39 
 
 		 769 aa  58.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  31.8 
 
 		 982 aa  57.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  27.76 
 
 		 1287 aa  57.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  34.09 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  25.07 
 
 		 3209 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  26.3 
 
 		 833 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 		 467 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  25.86 
 
 		 855 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  31.48 
 
 		 713 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  27.83 
 
 		 682 aa  55.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.18 
 
 		 2689 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.62 
 
 		 4798 aa  55.1  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  26.33 
 
 		 437 aa  55.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>