More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2425 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1055    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  29.78 
 
 
2911 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.33 
 
 
1079 aa  120  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.21 
 
 
2678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.79 
 
 
2775 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  30.53 
 
 
556 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  28.49 
 
 
589 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.91 
 
 
833 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  28.78 
 
 
3954 aa  88.6  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  32.2 
 
 
1884 aa  88.6  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  27.44 
 
 
2097 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  31.16 
 
 
4334 aa  88.2  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  27.39 
 
 
824 aa  87.8  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  32.13 
 
 
595 aa  87.8  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  28.65 
 
 
795 aa  86.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  27.53 
 
 
942 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  29.62 
 
 
851 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  29.23 
 
 
1421 aa  84.7  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  26.05 
 
 
860 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  34.01 
 
 
534 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  27.97 
 
 
2954 aa  83.6  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  31.62 
 
 
2950 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  28.48 
 
 
1072 aa  83.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  32.3 
 
 
907 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  31.73 
 
 
1112 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  30.81 
 
 
518 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  29.04 
 
 
2836 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  30.39 
 
 
2133 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  30.03 
 
 
2667 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  25.43 
 
 
855 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  30.17 
 
 
648 aa  80.1  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  25.21 
 
 
1156 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  27.52 
 
 
1499 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  30.95 
 
 
1286 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  29.39 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  29.39 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  27.14 
 
 
1145 aa  77  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  27.46 
 
 
1400 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.5 
 
 
3598 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.4 
 
 
1112 aa  76.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.12 
 
 
4798 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  29.74 
 
 
928 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  26.77 
 
 
1582 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.19 
 
 
2807 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  28.69 
 
 
928 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  27.11 
 
 
682 aa  74.7  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  30.49 
 
 
3619 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  31.03 
 
 
526 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  30.49 
 
 
3619 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  28.93 
 
 
1855 aa  73.9  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  28.09 
 
 
946 aa  73.9  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  31.14 
 
 
341 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.62 
 
 
2245 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  28.44 
 
 
2467 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  28.53 
 
 
3026 aa  72.4  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  30.64 
 
 
4800 aa  72.8  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  33.83 
 
 
2296 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  27.13 
 
 
2198 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  31.62 
 
 
3608 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  32.18 
 
 
759 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  29.87 
 
 
982 aa  70.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  43 
 
 
3091 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  45.28 
 
 
734 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  30.17 
 
 
764 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  46.07 
 
 
460 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.05 
 
 
5769 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  27.11 
 
 
1814 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.75 
 
 
1553 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  28.77 
 
 
4723 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.04 
 
 
1236 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  29.29 
 
 
745 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.15 
 
 
1279 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  37.1 
 
 
613 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.02 
 
 
3427 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  44.34 
 
 
741 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.95 
 
 
1963 aa  68.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  54.1 
 
 
1610 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.59 
 
 
2668 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  27.78 
 
 
889 aa  67.8  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.83 
 
 
5962 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.04 
 
 
1415 aa  67.8  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  46.08 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.79 
 
 
2107 aa  67.8  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  44.71 
 
 
1175 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  28.39 
 
 
932 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  32.14 
 
 
232 aa  67  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  31.92 
 
 
1544 aa  67  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  56.67 
 
 
1610 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.15 
 
 
1019 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  28.7 
 
 
3209 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  30.87 
 
 
516 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  45.37 
 
 
525 aa  66.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.62 
 
 
980 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3148  hemolysin-type calcium-binding region  31.56 
 
 
493 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0237525  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.9 
 
 
1180 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  56.67 
 
 
7149 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  29.96 
 
 
901 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 
507 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  43.33 
 
 
460 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  26.34 
 
 
1168 aa  66.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>