More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0872 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 152 aa  310  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  56.46 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  44 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03022  general secretion pathway protein H  47.3 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  46.61 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  40.74 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  40.74 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  38.31 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  48.44 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  56.41 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  42.98 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  38.89 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  42.11 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  40.56 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  41.32 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  37.33 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  36.8 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  36.8 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  37.16 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  38.35 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  41.73 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  38 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  40.5 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  34.4 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  38.71 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  41.59 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  42 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0193  pilus assembly protein PilE  44.44 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  51.56 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.36 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  35.71 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  53.73 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  38.74 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  35.14 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  50 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.98 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  40.91 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0268  putative pilin protein PilE  38.46 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.405094  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  34.48 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  34.84 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  34.92 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.74 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.1 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.53 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.59 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  48.57 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  41.11 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  33.56 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  39.37 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  38.18 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0493  methylation  41.98 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  32.88 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2839  protein involved in methylation  38.28 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273449  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  44.87 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.61 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  47.62 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.78 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  50.72 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  37.27 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.74 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  52.54 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.67 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  52.54 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  39.53 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.09 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.3 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  52.38 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0220  pilus assembly protein  38.84 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.1 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.18 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  32.79 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  52.54 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  32.79 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  52.54 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  31.25 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  50 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.83 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.85 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.46 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  35.51 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0239  pilus assembly protein PilE  36.36 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.179125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  33.59 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  33.04 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  50 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.3 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.82 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.77 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  37.36 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.57 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.72 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.85 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.61 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.8 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  61.9 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.24 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  48.44 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  56.6 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  36.54 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  44.07 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>