112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0740 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 409 aa  820    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  65.93 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  46.7 
 
 		 253 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  52.29 
 
 		 514 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  45.4 
 
 		 670 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  45.64 
 
 		 1035 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  41.4 
 
 		 2002 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  35.56 
 
 		 333 aa  99.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2620  Cna B domain protein  47.86 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208215  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  42.03 
 
 		 480 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  35.52 
 
 		 343 aa  92.8  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  50.54 
 
 		 340 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  42.54 
 
 		 3507 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  39.83 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  51.55 
 
 		 2068 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  49.38 
 
 		 2286 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  35.06 
 
 		 995 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  39.1 
 
 		 1310 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  38.05 
 
 		 1042 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  46.07 
 
 		 2334 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 746 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  48.1 
 
 		 4433 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  42.71 
 
 		 14944 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0745  hypothetical protein  36.88 
 
 		 146 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  32.67 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  41.84 
 
 		 1363 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  49.4 
 
 		 1272 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  41.84 
 
 		 1363 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  35.21 
 
 		 779 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  33.1 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  39.81 
 
 		 1303 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  39.05 
 
 		 1055 aa  61.6  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  39.8 
 
 		 1380 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  43.4 
 
 		 795 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  34.19 
 
 		 580 aa  60.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 771 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  40.24 
 
 		 673 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  43.96 
 
 		 1299 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  31.95 
 
 		 1067 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  40.57 
 
 		 1299 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  32.42 
 
 		 9585 aa  57.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  41.33 
 
 		 861 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  33.86 
 
 		 566 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  35.16 
 
 		 918 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  33.05 
 
 		 1735 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  30.4 
 
 		 1199 aa  54.3  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  41.67 
 
 		 1973 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  29.73 
 
 		 587 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  41.18 
 
 		 1160 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  39.29 
 
 		 1113 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  30.83 
 
 		 718 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  30.67 
 
 		 903 aa  52.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  38.38 
 
 		 1377 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 776 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  26.9 
 
 		 1401 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.82 
 
 		 590 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  34.65 
 
 		 1307 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  45.68 
 
 		 648 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  40.86 
 
 		 1601 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  34.86 
 
 		 948 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  31.16 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  33.94 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.26 
 
 		 649 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  31.58 
 
 		 701 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  30.77 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  39.39 
 
 		 1248 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  36.45 
 
 		 1430 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  35.71 
 
 		 841 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  32.5 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  32.79 
 
 		 165 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  29.59 
 
 		 1401 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  35.65 
 
 		 836 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  31.06 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  30.34 
 
 		 190 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  42.17 
 
 		 649 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  33.33 
 
 		 997 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0414  hypothetical protein  36.52 
 
 		 884 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  30.84 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  38.03 
 
 		 674 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  31.25 
 
 		 999 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  33.86 
 
 		 782 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  30.77 
 
 		 2170 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  42.03 
 
 		 3027 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40.74 
 
 		 743 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  27.01 
 
 		 1063 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  29.21 
 
 		 3802 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  30.34 
 
 		 190 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  32 
 
 		 185 aa  46.6  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  30.84 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  36.54 
 
 		 715 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  31.45 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  30.84 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  30.84 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 2927 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  43.48 
 
 		 717 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  31.31 
 
 		 853 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1521  hypothetical protein  29.55 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812008  normal  0.0835787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  31.03 
 
 		 680 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1022 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  29.41 
 
 		 224 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>