More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0522 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  100 
 
 		 461 aa  910    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  40.5 
 
 		 445 aa  331  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  38.55 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  31.83 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  31.96 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  31.87 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  30.53 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  32.2 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  30.32 
 
 		 459 aa  209  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  29.64 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 450 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  31.39 
 
 		 479 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  29.44 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  28.96 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  26.81 
 
 		 461 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  26.37 
 
 		 461 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 456 aa  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 472 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  22.36 
 
 		 460 aa  143  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 453 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 484 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  23.78 
 
 		 463 aa  119  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.65 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25.65 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  25.18 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  23.18 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 464 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 464 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 458 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  25.11 
 
 		 440 aa  107  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 466 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  22.44 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  19.83 
 
 		 469 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  23.15 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  23.84 
 
 		 439 aa  95.1  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  22.41 
 
 		 478 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  23.98 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 464 aa  92.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  19.64 
 
 		 461 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 469 aa  90.1  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  21.04 
 
 		 459 aa  90.1  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  25.45 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  23.53 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  22.09 
 
 		 480 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  25.13 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  21.64 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  21.21 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  23.14 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  22.92 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  23.44 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  21.64 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22.25 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22.25 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  22.35 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.25 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  21.62 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  21.91 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  21.46 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.25 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.25 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  19.95 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  22.7 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  23.42 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  21.78 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  21.54 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  21.9 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  20.18 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  21.83 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  20.4 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>