More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0976 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
610 aa  1238    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  46.57 
 
 
523 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  51.14 
 
 
440 aa  433  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  38.12 
 
 
570 aa  357  5e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  35.47 
 
 
650 aa  340  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  40.47 
 
 
561 aa  316  9e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  34.66 
 
 
596 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  36.06 
 
 
556 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 
661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  35.51 
 
 
495 aa  282  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  33.98 
 
 
522 aa  265  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  32.22 
 
 
498 aa  257  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  28.81 
 
 
733 aa  253  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  32.16 
 
 
523 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  38.4 
 
 
451 aa  250  6e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 
405 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  30.77 
 
 
534 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.42 
 
 
617 aa  205  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  27.5 
 
 
620 aa  204  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  29.65 
 
 
544 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.49 
 
 
530 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.03 
 
 
515 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.77 
 
 
534 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  29.31 
 
 
506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  28.96 
 
 
498 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  26.53 
 
 
618 aa  183  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  28.18 
 
 
507 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  27.42 
 
 
547 aa  181  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  28.16 
 
 
638 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  31.38 
 
 
499 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  27.59 
 
 
587 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32 
 
 
459 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.85 
 
 
395 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  27.49 
 
 
546 aa  173  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.32 
 
 
457 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.72 
 
 
457 aa  172  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.09 
 
 
543 aa  170  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  29.3 
 
 
487 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  28.29 
 
 
527 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  26.92 
 
 
595 aa  169  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  27.27 
 
 
518 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  30.39 
 
 
492 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 
524 aa  167  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  29.29 
 
 
476 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.73 
 
 
464 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.35 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  29.55 
 
 
476 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  31.17 
 
 
580 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  29.55 
 
 
476 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  28.81 
 
 
473 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  28.16 
 
 
552 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  30.18 
 
 
447 aa  162  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.54 
 
 
554 aa  161  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  25.96 
 
 
556 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  28.65 
 
 
484 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  27.05 
 
 
539 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.29 
 
 
455 aa  158  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.22 
 
 
475 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  27.27 
 
 
498 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  26.33 
 
 
517 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  26.97 
 
 
519 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  29.07 
 
 
499 aa  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  33.04 
 
 
446 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  25.45 
 
 
511 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  27.88 
 
 
487 aa  151  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.88 
 
 
499 aa  150  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.92 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  26.23 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  30.62 
 
 
442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.43 
 
 
406 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.43 
 
 
406 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.43 
 
 
406 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.43 
 
 
455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  27.41 
 
 
517 aa  148  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  32.2 
 
 
281 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  31.32 
 
 
511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  24.21 
 
 
612 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  24.21 
 
 
612 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  27.51 
 
 
548 aa  147  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  27.72 
 
 
553 aa  146  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  26.23 
 
 
471 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  25.74 
 
 
544 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.94 
 
 
532 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  28.42 
 
 
514 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  27.94 
 
 
515 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  26.77 
 
 
519 aa  145  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  28.22 
 
 
515 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  28.42 
 
 
515 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  27.94 
 
 
519 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  25.81 
 
 
539 aa  144  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  27.73 
 
 
515 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  27.94 
 
 
515 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  26.1 
 
 
474 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  31.29 
 
 
451 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  24.64 
 
 
555 aa  144  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  25.67 
 
 
564 aa  144  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  29.12 
 
 
515 aa  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.43 
 
 
452 aa  143  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.43 
 
 
452 aa  143  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>