More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0212 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  52.15 
 
 
235 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  44.56 
 
 
195 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  43.16 
 
 
190 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  44.51 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 
189 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  43.32 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 
188 aa  138  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31.9 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
196 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
329 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.99 
 
 
231 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 
248 aa  88.6  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2022  isochorismatase hydrolase  36.04 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.24 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.52 
 
 
230 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.52 
 
 
230 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 
231 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.52 
 
 
231 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.52 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.52 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
231 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 
187 aa  85.1  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.05 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  31.31 
 
 
389 aa  82.4  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  31.03 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  33.52 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  33.33 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  33.88 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  34.46 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 
189 aa  79  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
230 aa  79  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
223 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  34.05 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  33.15 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.55 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  31.28 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  30.92 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 
247 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.52 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  33.51 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  33.51 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  33.16 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  31.96 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  30.86 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.09 
 
 
186 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  31.25 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  30.37 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
266 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>