99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4091 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
430 aa  841    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  35.73 
 
 
499 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 
489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  30.85 
 
 
446 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 
539 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 
453 aa  97.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 
447 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 
461 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 
512 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  31.69 
 
 
495 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  19.85 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 
494 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 
495 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  26.57 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  26.09 
 
 
495 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  20.37 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  21.66 
 
 
467 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  26.02 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 
484 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  19.51 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  26.32 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  21.59 
 
 
496 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 
489 aa  69.7  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  25.64 
 
 
490 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  24.35 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
482 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 
498 aa  63.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 
444 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  18.93 
 
 
495 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  24.86 
 
 
508 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.72 
 
 
488 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 
477 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 
504 aa  56.6  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 
440 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  23.43 
 
 
499 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  19.91 
 
 
460 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 
465 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 
444 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  17.53 
 
 
474 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 
440 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 
475 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  21.59 
 
 
461 aa  53.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  26.4 
 
 
472 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
582 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
424 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  19 
 
 
431 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 
464 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 
478 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  21.36 
 
 
458 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  19.74 
 
 
536 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 
516 aa  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  24.37 
 
 
467 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
500 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 
135 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 
546 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 
509 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  18.91 
 
 
507 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 
429 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 
411 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  20.22 
 
 
491 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 
547 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
505 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 
470 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 
476 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  20.87 
 
 
458 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  22.75 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 
505 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
463 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  20.13 
 
 
456 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  22.67 
 
 
501 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1835  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
465 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 
429 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  19.54 
 
 
499 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 
436 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 
446 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 
470 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 
455 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
458 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 
511 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4704  polysaccharide biosynthesis protein  20.67 
 
 
498 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318996  normal  0.409753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 
456 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  20.38 
 
 
456 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 
433 aa  43.1  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>