13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1835 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1835  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 465 aa  900    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2505  polysaccharide biosynthesis protein  57.68 
 
 		 459 aa  496  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2510  polysaccharide biosynthesis protein  38.05 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.04 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 476 aa  53.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  26.09 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 461 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4129  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 477 aa  47  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08681  hypothetical protein  28.09 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.457188  unclonable  0.0000000778703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>