More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2625 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  100 
 
 		 409 aa  843    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  50.89 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  28.21 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.23 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  29.05 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.79 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 391 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.37 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.37 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  26.57 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.46 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.96 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.47 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  27.71 
 
 		 370 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.66 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.3 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.42 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  28 
 
 		 383 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.54 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.59 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.57 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.44 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.83 
 
 		 378 aa  107  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  23.58 
 
 		 357 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.25 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  22.46 
 
 		 477 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.68 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.82 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.06 
 
 		 506 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.11 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  25.68 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.29 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.07 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  26.36 
 
 		 323 aa  97.1  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25.87 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  23.79 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  23.86 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  22.64 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.39 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.02 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.93 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 471 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 471 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  21.43 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  22 
 
 		 386 aa  86.3  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  23.39 
 
 		 404 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  22.06 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  22.51 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  22.02 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  21.06 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  24.68 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  23.95 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  24.37 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  23.47 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  22.98 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  22.63 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  23.3 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  24.69 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  26.13 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  22.73 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  22.65 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  22.56 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  28.16 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  25.89 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  24.45 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25.51 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  23.2 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  22.29 
 
 		 656 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  25.24 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  24.46 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  23.03 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  21.55 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  22.83 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  23.33 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  25.17 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  22.57 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  22.31 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.11 
 
 		 365 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  23.64 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  20.94 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  24.44 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  20.71 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.83 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.83 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  21.1 
 
 		 376 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  22.48 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  22.45 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  24.82 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  28.76 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  22.34 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  21.03 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>