81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5202 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 587 aa  1227    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  61.36 
 
 		 588 aa  757    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  36.52 
 
 		 562 aa  306  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  36.97 
 
 		 564 aa  300  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 513 aa  163  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 539 aa  153  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  25.66 
 
 		 537 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  24.96 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 543 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 527 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  27.3 
 
 		 539 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 575 aa  93.6  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 577 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  33.57 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 530 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 578 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  22.67 
 
 		 555 aa  67.4  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  35.42 
 
 		 540 aa  67  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 530 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 594 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  31.69 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.16 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 561 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  30.22 
 
 		 519 aa  56.6  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  22.83 
 
 		 570 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 507 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 488 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 469 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  23.16 
 
 		 537 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 582 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 493 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  21.31 
 
 		 538 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  24.72 
 
 		 511 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  22.98 
 
 		 511 aa  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 579 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  26.95 
 
 		 492 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  23 
 
 		 478 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 487 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 533 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 472 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 491 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  23.62 
 
 		 498 aa  47  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  22.78 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 503 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 582 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  22.83 
 
 		 486 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 513 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 560 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 512 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 566 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 664 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 451 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 565 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  34.35 
 
 		 494 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  21.95 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 480 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  33.59 
 
 		 457 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 624 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 583 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 548 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  25.64 
 
 		 511 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 592 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 604 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 499 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 501 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  22.47 
 
 		 592 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  34.44 
 
 		 491 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 502 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 549 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>