More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1078 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 727 aa  1446    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  54.55 
 
 		 626 aa  544  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  51.75 
 
 		 699 aa  534  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  48.07 
 
 		 626 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  48.05 
 
 		 763 aa  482  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  48.13 
 
 		 796 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  46.15 
 
 		 658 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  45.88 
 
 		 750 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  46.15 
 
 		 734 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  44.48 
 
 		 775 aa  445  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  44.69 
 
 		 735 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  45.14 
 
 		 739 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  44.62 
 
 		 720 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  45.16 
 
 		 757 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  43.46 
 
 		 734 aa  428  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  46.81 
 
 		 810 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  42.72 
 
 		 714 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  44.36 
 
 		 779 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  44.36 
 
 		 776 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  43.53 
 
 		 728 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  44.62 
 
 		 732 aa  422  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  43.71 
 
 		 714 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  42.53 
 
 		 727 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  44.89 
 
 		 651 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  42.83 
 
 		 728 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  44.48 
 
 		 814 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  42.43 
 
 		 727 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  41.08 
 
 		 833 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  39.48 
 
 		 720 aa  412  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  43.16 
 
 		 741 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  42.91 
 
 		 712 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  42.72 
 
 		 815 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  42.16 
 
 		 691 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  44.23 
 
 		 830 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  44.23 
 
 		 830 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  40 
 
 		 768 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  40.87 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  41.25 
 
 		 714 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  41 
 
 		 750 aa  389  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  40.54 
 
 		 707 aa  382  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  39.71 
 
 		 759 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  43.65 
 
 		 723 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  43.08 
 
 		 669 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  41.4 
 
 		 770 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  41.65 
 
 		 724 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  39.68 
 
 		 760 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  39.89 
 
 		 718 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  41.22 
 
 		 763 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  41.47 
 
 		 718 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  41.22 
 
 		 730 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  40.26 
 
 		 769 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  37.27 
 
 		 742 aa  375  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  40.44 
 
 		 750 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  38.9 
 
 		 736 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  41.65 
 
 		 724 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  39.05 
 
 		 759 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  39.71 
 
 		 744 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  39.78 
 
 		 757 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  38.28 
 
 		 728 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  36.91 
 
 		 760 aa  365  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  42.31 
 
 		 733 aa  362  9e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  38.84 
 
 		 758 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  38.19 
 
 		 712 aa  362  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  38.41 
 
 		 765 aa  362  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  38.41 
 
 		 784 aa  361  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  41.3 
 
 		 656 aa  353  5e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  38.9 
 
 		 732 aa  353  8.999999999999999e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  38.07 
 
 		 709 aa  351  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  37.86 
 
 		 764 aa  351  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  38.62 
 
 		 743 aa  345  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  38.04 
 
 		 712 aa  341  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 		 831 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  38.07 
 
 		 788 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  36.93 
 
 		 788 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  38.02 
 
 		 729 aa  325  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  37.19 
 
 		 776 aa  324  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  36.67 
 
 		 811 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  40.65 
 
 		 761 aa  323  6e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  38.17 
 
 		 824 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  36.61 
 
 		 668 aa  319  9e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  37.34 
 
 		 712 aa  319  9e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  37.66 
 
 		 735 aa  318  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  37.98 
 
 		 824 aa  317  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  37.41 
 
 		 661 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.37 
 
 		 776 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  37.22 
 
 		 626 aa  312  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.21 
 
 		 751 aa  310  5e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  37.14 
 
 		 658 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  36.44 
 
 		 676 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  36.92 
 
 		 680 aa  306  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  37.48 
 
 		 681 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  37.84 
 
 		 646 aa  303  9e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.98 
 
 		 648 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  35.65 
 
 		 755 aa  303  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  35.77 
 
 		 705 aa  301  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  39.54 
 
 		 618 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  37.24 
 
 		 765 aa  300  6e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  36.85 
 
 		 692 aa  297  5e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.88 
 
 		 643 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  34.56 
 
 		 751 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>