More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2665 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  100 
 
 		 407 aa  824    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  56.26 
 
 		 414 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3189  phage integrase family protein  74.25 
 
 		 259 aa  362  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000104193  normal  0.041217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  45.74 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  41.13 
 
 		 373 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  44.11 
 
 		 242 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  30.18 
 
 		 447 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  29.95 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.95 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  30.46 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  29.2 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  29.61 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  28.91 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.68 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.36 
 
 		 477 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  29.04 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.28 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  29.63 
 
 		 378 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  27.91 
 
 		 369 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.2 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  26.29 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.14 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.09 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.43 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  31.12 
 
 		 371 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  26.59 
 
 		 422 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  34.35 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.17 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.37 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.01 
 
 		 305 aa  97.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  25.37 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.89 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.94 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.95 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  35.23 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.55 
 
 		 370 aa  90.1  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  28.05 
 
 		 487 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.61 
 
 		 365 aa  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  27.88 
 
 		 463 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.53 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  28.03 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  29.23 
 
 		 397 aa  89  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.84 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  30.15 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.73 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  27.09 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.14 
 
 		 402 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.07 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  28.65 
 
 		 656 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  24.78 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  26.15 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  29.1 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30.19 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.79 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.23 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.4 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.36 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  32.6 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  28.06 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  29.29 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  25.06 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  25.33 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24.94 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.65 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.65 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  24.71 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  27.24 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.01 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  24.36 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  25.68 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  25.54 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  26.45 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  26.67 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.36 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.77 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  26.04 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.4 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  27.5 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.31 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  24.54 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  26.26 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  31.48 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  26.89 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.51 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  32.99 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.03 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>