More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1008 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  100 
 
 		 449 aa  916    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  45.27 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  44.87 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  38.36 
 
 		 438 aa  309  5.9999999999999995e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  41.13 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  39.61 
 
 		 456 aa  286  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  36.74 
 
 		 449 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.97 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 480 aa  252  1e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  28.92 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  30.37 
 
 		 440 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.83 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.01 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 445 aa  149  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  30.4 
 
 		 434 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 467 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 452 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  29.94 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  28.24 
 
 		 437 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 452 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 444 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 442 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  30.49 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  29.63 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.51 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.25 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 420 aa  100  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 454 aa  97.1  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 449 aa  93.6  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 		 504 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.38 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 421 aa  86.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 418 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.94 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.63 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  29.34 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.64 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  37.96 
 
 		 157 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  24.94 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.93 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.33 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  23.53 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.29 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.51 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.84 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.48 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>