84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1044 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  100 
 
 		 693 aa  1388    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  59.29 
 
 		 567 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  53.28 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  50.27 
 
 		 547 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  43.8 
 
 		 541 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  49.49 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  50.8 
 
 		 407 aa  363  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  37.21 
 
 		 850 aa  350  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  46.23 
 
 		 604 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  47.27 
 
 		 403 aa  335  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  44.73 
 
 		 408 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  40.9 
 
 		 411 aa  323  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  39.41 
 
 		 727 aa  323  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  48.49 
 
 		 471 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  45.43 
 
 		 399 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  46.52 
 
 		 597 aa  312  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  45.76 
 
 		 548 aa  312  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  43.3 
 
 		 387 aa  288  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  42.04 
 
 		 568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  41.76 
 
 		 558 aa  250  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  38.72 
 
 		 574 aa  244  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  37.34 
 
 		 413 aa  213  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  34.05 
 
 		 631 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  36.12 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  33.67 
 
 		 636 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  40.55 
 
 		 320 aa  200  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  35.01 
 
 		 535 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  32.13 
 
 		 532 aa  190  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  32.04 
 
 		 677 aa  187  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  33.71 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  31.71 
 
 		 658 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  32.07 
 
 		 533 aa  183  9.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  31.87 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  35.21 
 
 		 640 aa  181  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.93 
 
 		 583 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  31.28 
 
 		 612 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  31.01 
 
 		 441 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.63 
 
 		 445 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  40.91 
 
 		 1392 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.54 
 
 		 589 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  27.75 
 
 		 433 aa  142  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  53.24 
 
 		 812 aa  141  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  48.98 
 
 		 970 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  48.98 
 
 		 693 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  47.33 
 
 		 601 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  29.5 
 
 		 450 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  45.86 
 
 		 1193 aa  133  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  30.71 
 
 		 587 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  26.7 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  25.53 
 
 		 453 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  27.53 
 
 		 737 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  29.85 
 
 		 427 aa  124  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  39.69 
 
 		 1236 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.21 
 
 		 1424 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  29.8 
 
 		 445 aa  120  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  29.21 
 
 		 442 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  38.86 
 
 		 1206 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  28.31 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  28.96 
 
 		 469 aa  104  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  31.36 
 
 		 1193 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  39.84 
 
 		 1069 aa  94  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  40.74 
 
 		 1295 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  27.14 
 
 		 440 aa  89.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.94 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  32.22 
 
 		 1479 aa  84.3  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  36.62 
 
 		 2142 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  32.65 
 
 		 1687 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  31.76 
 
 		 1465 aa  60.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  28.08 
 
 		 1455 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  31.63 
 
 		 248 aa  55.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  33.33 
 
 		 1119 aa  52  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  29.6 
 
 		 1108 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  42.59 
 
 		 675 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  34.78 
 
 		 734 aa  48.9  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  25 
 
 		 1172 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.22 
 
 		 674 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  30.48 
 
 		 699 aa  48.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  35.56 
 
 		 713 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  30.95 
 
 		 709 aa  47.8  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  26.99 
 
 		 701 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2846  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  28.16 
 
 		 624 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  31.37 
 
 		 724 aa  45.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.68 
 
 		 699 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  44.23 
 
 		 684 aa  44.3  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>