116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0043 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0043  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  366  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  49.19 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  49.19 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  47.78 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  52.05 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 182 aa  150  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 191 aa  141  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3102  regulatory protein TetR  48.02 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 180 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  28.03 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  25.47 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  26.75 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  26.35 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  21.23 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1648  hypothetical protein  20.67 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273732 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3845  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  23.48 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2272  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4612  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  27.15 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  26.05 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.61 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  29.19 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  20.51 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  24.73 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>