More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0646 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0646  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 291 aa  568  1e-161  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0593  MscS mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  0.970909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.92 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  25.53 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  24.28 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  30.77 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  25.17 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  24.5 
 
 		 807 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  24.31 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 807 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.92 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  24.83 
 
 		 855 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 		 853 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  24.83 
 
 		 803 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  24.83 
 
 		 803 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  26.56 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 981 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  21.07 
 
 		 825 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  25.56 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  27.27 
 
 		 804 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  23.87 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  23.61 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  23.46 
 
 		 840 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  21.97 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  20.67 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  21.03 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  19.88 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 685 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 551 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 551 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  23.46 
 
 		 840 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 864 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  25 
 
 		 891 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 549 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 549 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 533 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 549 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  25.44 
 
 		 883 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  26.7 
 
 		 1111 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 384 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 803 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  23.83 
 
 		 835 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 		 840 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 550 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 544 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  20.3 
 
 		 338 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  27.56 
 
 		 418 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 547 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  25.64 
 
 		 479 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  27.68 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  22.27 
 
 		 1120 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  22.27 
 
 		 1120 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  22.27 
 
 		 1120 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  22.27 
 
 		 1120 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  32.69 
 
 		 348 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1120 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  22.27 
 
 		 1120 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  22.27 
 
 		 1120 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  31 
 
 		 534 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 614 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  22.27 
 
 		 1118 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  22.27 
 
 		 1120 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 561 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 		 355 aa  53.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  24.36 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  26.92 
 
 		 532 aa  52.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 414 aa  52.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  25.68 
 
 		 316 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  28.3 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  21.43 
 
 		 1118 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1649  MscS Mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  25.17 
 
 		 794 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 460 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  26.47 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  21.43 
 
 		 1120 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 547 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 		 867 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>